RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 CASS4Q9NQ75 786 aa18.54■□□□□ 0.56
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-220ENST00000511663 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-220ENST00000511663 MRFAP1Q9Y605 127 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-220ENST00000511663 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPN13Q12923 2485 aa18.54■□□□□ 0.56
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SH3BP2-220ENST00000511663 PAK5Q9P286 719 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-220ENST00000511663 TCAF1Q9Y4C2 921 aa18.53■□□□□ 0.56
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SH3BP2-220ENST00000511663 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-220ENST00000511663 C1orf54Q8WWF1 131 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-220ENST00000511663 KLHL20Q9Y2M5 609 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-220ENST00000511663 SEC16AO15027 2179 aa18.51■□□□□ 0.55
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SH3BP2-220ENST00000511663 AGPSO00116 658 aa18.51■□□□□ 0.55
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SH3BP2-220ENST00000511663 RAD51AP1Q96B01 352 aa18.51■□□□□ 0.55
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF778Q96MU6 729 aa18.51■□□□□ 0.55
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
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SH3BP2-220ENST00000511663 CDC23Q9UJX2 597 aa18.51■□□□□ 0.55
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SH3BP2-220ENST00000511663 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa18.5■□□□□ 0.55
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SH3BP2-220ENST00000511663 CTSBP07858 339 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 ITGA3P26006 1051 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 AOAHP28039 575 aa18.5■□□□□ 0.55
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SH3BP2-220ENST00000511663 SOX8P57073 446 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF534Q76KX8 674 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 OVCH1Q7RTY7 1134 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 VRK3Q8IV63 474 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 KRT222Q8N1A0 295 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 OTUD6BQ8N6M0 293 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 MAGEC3Q8TD91 643 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 FKBP10Q96AY3 582 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 SELENOSQ9BQE4 189 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 CHRAC1Q9NRG0 131 aa18.5■□□□□ 0.55
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