RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503613.5

FBXO38-206, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 627 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-206	ENST00000503613	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	NRG4	Q8WWG1	115 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	PYCR2	Q96C36	320 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	LRRC58	Q96CX6	371 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	TEX37	Q96LM6	180 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	PKP4	Q99569	1192 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	ZBTB18	Q99592	522 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	TEX101	Q9BY14	249 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613		A0A1W2PP55	124 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	ASPDH	A6ND91	283 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	FXYD1	O00168	92 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	CLGN	O14967	610 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	MAP3K7	O43318	606 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	SEC22B	O75396	215 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	STAMBP	O95630	424 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	BAG2	O95816	211 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	PCCB	P05166	539 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	C7	P10643	843 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	PRPS2	P11908	318 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	HSD17B1	P14061	328 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	ACADL	P28330	430 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	MAPK1	P28482	360 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	IMPA1	P29218	277 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	IL12A	P29459	219 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	CTH	P32929	405 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	HAL	P42357	657 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	CASP2	P42575	452 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	PNLIPRP1	P54315	467 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	SEC13	P55735	322 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	CDK3	Q00526	305 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	IRF8	Q02556	426 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	NAE1	Q13564	534 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	NFYC	Q13952	458 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	E2F2	Q14209	437 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	FRG2	Q64ET8	278 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	XKR5	Q6UX68	686 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	OXR1	Q8N573	874 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	RNF148	Q8N7C7	305 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	HIPK4	Q8NE63	616 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	FRG2B	Q96QU4	278 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	HBEGF	Q99075	208 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	ACPT	Q9BZG2	426 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	VCX3B	Q9H321	246 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	MUC13	Q9H3R2	512 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	ACTL8	Q9H568	366 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	SCML1	Q9UN30	329 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613		C9JVG2	144 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613		H0YIV9	168 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613		H3BNX3	289 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	NME4	O00746	187 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	KMO	O15229	486 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	PRAMEF4	O60810	478 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	SLC16A8	O95907	504 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	DNTT	P04053	509 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	C8B	P07358	591 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	HSD3B1	P14060	373 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	DRD1	P21728	446 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	SLC6A2	P23975	617 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	HSD3B2	P26439	372 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	TRIM23	P36406	574 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	HMGCS1	Q01581	520 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	BNIP2	Q12982	314 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FBXO38-206	ENST00000503613	KIAA0040	Q15053	153 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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