RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 CYBBP04839 570 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 BPIP17213 487 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ITGALP20701 1170 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CTHP32929 405 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 AP1S1P61966 158 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PHKG1Q16816 387 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 IYDQ6PHW0 289 aa6.86□□□□□ -1.31
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HERC4-211ENST00000492996 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 STON2Q8WXE9 905 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TMEM74Q96NL1 305 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 DHRS7Q9Y394 339 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FAM149AA5PLN7 773 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PEX1O43933 1283 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NFATC1O95644 943 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CKMT2P17540 419 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ATP6V1B2P21281 511 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 OPRD1P41143 372 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ACADVLP49748 655 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 DGKEP52429 567 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CDKL1Q00532 357 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NFATC2Q13469 925 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SQSTM1Q13501 440 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NFYCQ13952 458 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NR1D2Q14995 579 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MTX3Q5HYI7 312 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 DET1Q7L5Y6 550 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CIB1Q99828 191 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 P2RY12Q9H244 342 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CD84Q9UIB8 345 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 USP22Q9UPT9 525 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CROCCQ5TZA2 2017 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CDH23Q9H251 3354 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.85□□□□□ -1.31
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HERC4-211ENST00000492996 KRT87PA6NCN2 255 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 K7EQS6 105 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FXYD1O00168 92 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FFAR2O15552 330 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 AKAP10O43572 662 aa6.85□□□□□ -1.31
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HERC4-211ENST00000492996 MTX2O75431 263 aa6.85□□□□□ -1.31
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HERC4-211ENST00000492996 MLYCDO95822 493 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MT-ND1P03886 318 aa6.85□□□□□ -1.31
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HERC4-211ENST00000492996 UROSP10746 265 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NCK1P16333 377 aa6.85□□□□□ -1.31
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HERC4-211ENST00000492996 GGT5P36269 586 aa6.85□□□□□ -1.31
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HERC4-211ENST00000492996 RELAQ04206 551 aa6.85□□□□□ -1.31
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HERC4-211ENST00000492996 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SBSNQ6UWP8 590 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TMEM25Q86YD3 366 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 STK40Q8N2I9 435 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NAT16Q8N8M0 369 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FNDC8Q8TC99 324 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 DLG3Q92796 817 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 IPPKQ9H8X2 491 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CD300AQ9UGN4 299 aa6.85□□□□□ -1.31
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