RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492648.2

TAF1B-209, Transcript of TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B, human

TSL 5

Gene TAF1B, Length 1,045 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1B-209	ENST00000492648	CHIT1	Q13231	466 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	GPM6B	Q13491	265 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	PTPA	Q15257	358 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	PROX1	Q92786	737 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	RITA1	Q96K30	269 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	UROC1	Q96N76	676 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	ASCL2	Q99929	193 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648		B4DGG1	531 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	WNT9B	O14905	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	RHOBTB1	O94844	696 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	ESRRB	O95718	433 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	CALCB	P10092	127 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	GLRA2	P23416	452 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	CCNC	P24863	283 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	PPP3CC	P48454	512 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	FMO5	P49326	533 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	MMP15	P51511	669 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	TAS2R38	P59533	333 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	ABR	Q12979	859 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	SPP2	Q13103	211 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	STIM1	Q13586	685 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	SNX1	Q13596	522 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	NPTX1	Q15818	432 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	CTF1	Q16619	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	TRIB2	Q92519	343 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	REPS1	Q96D71	796 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TAF1B-209	ENST00000492648	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.73	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms