RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 C1orf105O95561 183 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 CD63P08962 238 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 CHRM3P20309 590 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 MAGEA3P43357 314 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 GABRA4P48169 554 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 CENPUQ71F23 418 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 DNAJC22Q8N4W6 341 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 LINC01555Q8NAE3 123 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 HMGCLL1Q8TB92 370 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PROKR1Q8TCW9 393 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 SRPK3Q9UPE1 567 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 CRYL1Q9Y2S2 319 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 C9J4A7 227 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 H3BMH7 237 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 RFPL1O75677 317 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 USP1O94782 785 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 MATN4O95460 622 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PKMP14618 531 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 GBX1Q14549 363 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP1R7Q15435 360 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 RHBDD2Q6NTF9 364 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PCGF5Q86SE9 256 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 CALML6Q8TD86 181 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 DENND1AQ8TEH3 1009 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 SLCO2A1Q92959 643 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZUFSPQ96AP4 578 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 RUFY1Q96T51 708 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 TCFL5Q9UL49 500 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 SNX7Q9UNH6 387 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 E5RI56 91 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 SF1Q15637 639 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF470Q6ECI4 717 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 TCTN3Q6NUS6 607 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ANAPC2Q9UJX6 822 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PADI2Q9Y2J8 665 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 COMMD10Q9Y6G5 202 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 CTAGE9A4FU28 777 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 TARM1B6A8C7 271 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 NIPSNAP2O75323 286 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 NCF4Q15080 339 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 LONRF1Q17RB8 773 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB2Q8N680 514 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 EURLQ9NYK6 297 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 SPATA7Q9P0W8 599 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PCYOX1Q9UHG3 505 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF185O15231 689 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 CAPN1P07384 714 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 MAGP20916 626 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 RPS18P62269 152 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 NAA25Q14CX7 972 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 LCN10Q6JVE6 187 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM198BQ6UWH4 519 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 NEK10Q6ZWH5 1172 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 DLG3Q92796 817 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 IL17FQ96PD4 163 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 NAT9Q9BTE0 207 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 NDC1Q9BTX1 674 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ENAMQ9NRM1 1142 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 KLK4Q9Y5K2 254 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 NFS1Q9Y697 457 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 HSD17B2P37059 387 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP1-211ENST00000492545 ARSFP54793 590 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP1-211ENST00000492545 DCDP81605 110 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CTDSP1-211ENST00000492545 NFKB2Q00653 900 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP1-211ENST00000492545 IL10RAQ13651 578 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGAP19Q14CB8 494 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP1-211ENST00000492545 CYP2A13Q16696 494 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP1-211ENST00000492545 DEFB110Q30KQ9 67 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP1-211ENST00000492545 PTCHD3Q3KNS1 767 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP1-211ENST00000492545 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms