RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491660.1

SERP1-208, Transcript of stress associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SERP1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1-208ENST00000491660 PAFAH2Q99487 392 aa20.49■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.49■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.49■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.49■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SLC16A5O15375 505 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 PVRP15151 417 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 MSH2P43246 934 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SP140Q13342 867 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 KIR2DS3Q14952 304 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 RAPH1Q70E73 1250 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 MCOLN3Q8TDD5 553 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SLC46A1Q96NT5 459 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SLC12A9Q9BXP2 914 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 PARVBQ9HBI1 364 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SEMA5BQ9P283 1151 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 PDE10AQ9Y233 779 aa20.48■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SH3BP2P78314 561 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SLC29A2Q14542 456 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 CYP2A13Q16696 494 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 PHKG1Q16816 387 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 CARFQ8N187 725 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SPATA6LQ8N4H0 392 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 BMPERQ8N8U9 685 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 USP7Q93009 1102 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SLC41A2Q96JW4 573 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 TWSG1Q9GZX9 223 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 ASCL3Q9NQ33 180 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SLC39A1Q9NY26 324 aa20.47■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 HMX2A2RU54 273 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 B4E171 279 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 CDC7O00311 574 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 DXOO77932 396 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SLC16A8O95907 504 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 CCDC166P0CW27 439 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 ERGP11308 486 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 ST6GAL1P15907 406 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 HIST1H2ADP20671 130 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 GMPRP36959 345 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 TSPAN7P41732 249 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 PNLIPRP1P54315 467 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 HSD11B2P80365 405 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 FOXM1Q08050 763 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 KCNAB1Q14722 419 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 WDR93Q6P2C0 686 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 KMT5CQ86Y97 462 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 ZNF480Q8WV37 535 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 PMEPA1Q969W9 287 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 CTRCQ99895 268 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 H2AFJQ9BTM1 129 aa20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SERP1-208ENST00000491660 A0A0J9YY10 115 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 EBLN1P0CF75 366 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 PSMB5P28074 263 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 CRABP2P29373 138 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 OAS2P29728 719 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 HSD17B2P37059 387 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 SERPINB9P50453 376 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 MC2RQ01718 297 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 ARHGAP19Q14CB8 494 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 SLC5A12Q1EHB4 618 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 IGF2-ASQ6U949 168 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 TAOK1Q7L7X3 1001 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 SYTL1Q8IYJ3 562 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 SMPDL3AQ92484 453 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 CCDC138Q96M89 665 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 OR6C1Q96RD1 312 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 TAAR9Q96RI9 348 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.45■□□□□ 0.86
SERP1-208ENST00000491660 DERL2Q9GZP9 239 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms