RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ABCB8Q9NUT2 735 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM17Q9Y577 477 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PPW3 197 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF263O14978 683 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 FMO6PO60774 539 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 RLN1P04808 185 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 MNDAP41218 407 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 FMO5P49326 533 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 RGS7P49802 495 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 CA9Q16790 459 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SMU1Q2TAY7 513 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 EXOC3L1Q86VI1 746 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SORCS1Q8WY21 1168 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PROX1Q92786 737 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 EXOC4Q96A65 974 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SCRN2Q96FV2 425 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 RAD9AQ99638 391 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PLSCR5A0PG75 271 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 DUXAA6NLW8 204 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SNHG28P0DPA3 235 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 NR2C2P49116 596 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 MFAP3P55082 362 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 GBP6Q6ZN66 633 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 RTP3Q9BQQ7 232 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 MINDY3Q9H8M7 445 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 LMAN1LQ9HAT1 526 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 YDJCA8MPS7 323 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TULP2O00295 520 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PLOD2O00469 737 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 RPS6KA5O75582 802 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R3DO95685 299 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 THBS3P49746 956 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF132P52740 706 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PTENP60484 403 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 DMPKQ09013 629 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 KEAP1Q14145 624 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ODF4Q2M2E3 257 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 UGT3A2Q3SY77 523 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 CASC4Q6P4E1 433 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 CORO6Q6QEF8 472 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF852Q6ZMS4 543 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 DSG4Q86SJ6 1040 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PLD3Q8IV08 490 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 NAGSQ8N159 534 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T12Q8NG77 320 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PTP4A1Q93096 173 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM206Q9H813 350 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TUFT1Q9NNX1 390 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SEPT10Q9P0V9 454 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 JRKLQ9Y4A0 524 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PPK0 400 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 DENND3A2RUS2 1198 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SLC28A2O43868 658 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 C9P02748 559 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 MTCP1P56278 107 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 KLC1Q07866 573 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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