RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPN2P17706 415 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPAM1P38567 509 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PBX2P40425 430 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCAP31P51572 246 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LCN8Q6JVE9 175 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZUFSPQ96AP4 578 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POPDC3Q9HBV1 291 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SACM1LQ9NTJ5 587 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC25A13Q9UJS0 675 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS13AQ96RL7 3174 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A6NL46 340 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCR7P32248 378 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCT8P50990 548 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERVK-8P63133 956 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKG2Q13237 762 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SF1Q15637 639 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UTS2BQ765I0 119 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR141Q7Z602 305 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM217AQ8IXS0 508 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NXPE1Q8N323 547 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NXPE3Q969Y0 559 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAD9AQ99638 391 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NRTNQ99748 197 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C9orf16Q9BUW7 83 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC52A3Q9NQ40 469 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RIC8BQ9NVN3 520 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WWOXQ9NZC7 414 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR7A17O14581 309 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LDLRP01130 860 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITPKAP23677 461 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WASP42768 502 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARPC4P59998 168 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CARD16Q5EG05 197 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR107Q5VW38 600 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NSMCE2Q96MF7 247 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEP44Q9C0F1 390 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLQ9UEF7 1012 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 J3QRK9 145 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PFDN6O15212 129 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 S100BP04271 92 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HRH2P25021 359 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAMK2BQ13554 666 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP20A1Q6UW02 462 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XKR5Q6UX68 686 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATA19Q7Z5L4 167 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HS3ST5Q8IZT8 346 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBFAQ8N0V3 343 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC4FQ8N1N0 589 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHRSXQ8N5I4 330 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM86B1Q8N7N1 296 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXL8Q96CD0 374 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LMLNQ96KR4 655 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCN8AQ9UQD0 1980 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DFNA5O60443 496 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PREPP48147 710 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ESRRGP62508 458 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GTF2H2Q13888 395 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCEA2Q15560 299 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD34AQ69YU3 496 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF783Q6ZMS7 281 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STK32CQ86UX6 486 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CENPSQ8N2Z9 138 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB2Q8N680 514 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D23Q9NUY8 699 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UTS2RQ9UKP6 389 aa15.14■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH3P22223 829 aa15.13■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELK4P28324 431 aa15.13■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPS9P46781 194 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CROCCP3Q8IVE0 287 aa15.13■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPXM2Q8N436 756 aa15.13■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCRN2Q96FV2 425 aa15.13■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa15.13■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.13■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKAB1Q9Y478 270 aa15.13■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACOX3O15254 700 aa15.13■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GSNP06396 782 aa15.13■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GTDC1Q4AE62 458 aa15.13■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XKR7Q5GH72 579 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms