RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 GUCA1CO95843 209 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 IGHV4-39P01824 125 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SOAT1P35610 550 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CD86P42081 329 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SLC9A3P48764 834 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 FMO5P49326 533 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TUBB4BP68371 445 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PTPRCAPQ14761 206 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 MEP1BQ16820 701 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 WBP2NLQ6ICG8 309 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 MOXD1Q6UVY6 613 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 LINGO4Q6UY18 593 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SLC4A11Q8NBS3 891 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SPDL1Q96EA4 605 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TSPAN18Q96SJ8 248 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SEPHS2Q99611 448 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SPXQ9BT56 116 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 C1orf21Q9H246 121 aa4.69□□□□□ -1.66
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CCL20-204ENST00000489160 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SEPT10Q9P0V9 454 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 BLOC1S6Q9UL45 172 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PPI3 338 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ENO4A6NNW6 628 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PRR32B1ATL7 298 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 C16orf97H3BN30 126 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CAPN9O14815 690 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 OR10H2O60403 315 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CTSVO60911 334 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CETPP11597 493 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CKMT2P17540 419 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ACHEP22303 614 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 GAS1P54826 345 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 HSD17B7P56937 341 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 STX1BP61266 288 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PRKAA1Q13131 559 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 MFAP5Q13361 173 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 KIR2DS3Q14952 304 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ETFRF1Q6IPR1 90 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 GBP6Q6ZN66 633 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa4.68□□□□□ -1.66
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CCL20-204ENST00000489160 MAB21L3Q8N8X9 362 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CD101Q93033 1021 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SCRN2Q96FV2 425 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SFXN2Q96NB2 322 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PKP4Q99569 1192 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 BTBD10Q9BSF8 475 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 OSER1Q9NX31 292 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CHKBQ9Y259 395 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 LIPGQ9Y5X9 500 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PPM1 405 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 FEZF1A0PJY2 475 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TMEM221A6NGB7 291 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 RNF103O00237 685 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 BUB3O43684 328 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PRPSAP2O60256 369 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 RTN2O75298 545 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 REC8O95072 547 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 GBAP04062 536 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 VIMP08670 466 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 EEF2P13639 858 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CBLP22681 906 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 RPS18P62269 152 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 NPRL3Q12980 569 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ITGA7Q13683 1181 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TAZQ16635 292 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 VWC2Q2TAL6 325 aa4.67□□□□□ -1.66
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CCL20-204ENST00000489160 MDH1BQ5I0G3 518 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PLA2G4FQ68DD2 849 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 NHLRC2Q8NBF2 726 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 OR5M8Q8NGP6 311 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 OR13A1Q8NGR1 328 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CORO2AQ92828 525 aa4.67□□□□□ -1.66
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