RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	SNAP91	O60641	907 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ERCC2	P18074	760 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CTSS	P25774	331 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KIAA1024L	P59773	190 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MESD	Q14696	234 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF124	Q15973	351 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	C4orf22	Q6V702	233 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	APCDD1	Q8J025	514 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SNX31	Q8N9S9	440 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	P3H4	Q92791	437 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RFK	Q969G6	155 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	IFNK	Q9P0W0	207 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CFL2	Q9Y281	166 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PEX1	O43933	1283 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CIDEA	O60543	219 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	UBL4A	P11441	157 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KRT15	P19012	456 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PTPN3	P26045	913 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SCTR	P47872	440 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNC1	P48547	511 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	POLE2	P56282	527 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CTAG1A	P78358	180 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNJ10	P78508	379 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	HES3	Q5TGS1	186 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KAT2A	Q92830	837 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NT5M	Q9NPB1	228 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PIGV	Q9NUD9	493 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	HACD1	B0YJ81	288 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LMO7DN	F2Z398	122 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PLD2	O14939	933 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TJP3	O95049	919 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PCCB	P05166	539 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KRT16	P08779	473 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ETS2	P15036	469 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GAL	P22466	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC7A1	P30825	629 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC6A4	P31645	630 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GP5	P40197	560 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LSS	P48449	732 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNMA1	Q12791	1236 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	INSC	Q1MX18	579 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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