RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 LMCD1Q9NZU5 365 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 THEGQ9P2T0 379 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 A0A096LPI6 279 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 C5orf67F2Z3F1 127 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 H0YAE9 185 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 PRMT3O60678 531 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 SCELO95171 688 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 HPRP00739 348 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 RHOP08100 348 aa11.91□□□□□ -0.5
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PTPRF-212ENST00000477970 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
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PTPRF-212ENST00000477970 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
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PTPRF-212ENST00000477970 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
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PTPRF-212ENST00000477970 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa11.91□□□□□ -0.5
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PTPRF-212ENST00000477970 DTWD1Q8N5C7 304 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 TCEAL4Q96EI5 215 aa11.91□□□□□ -0.5
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PTPRF-212ENST00000477970 ACTR8Q9H981 624 aa11.91□□□□□ -0.5
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PTPRF-212ENST00000477970 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
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PTPRF-212ENST00000477970 TSPAN14Q8NG11 270 aa11.9□□□□□ -0.5
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PTPRF-212ENST00000477970 MCOLN3Q8TDD5 553 aa11.9□□□□□ -0.5
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PTPRF-212ENST00000477970 UGT2B28Q9BY64 529 aa11.9□□□□□ -0.5
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PTPRF-212ENST00000477970 TIMP2P16035 220 aa11.9□□□□□ -0.5
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PTPRF-212ENST00000477970 GZMMP51124 257 aa11.89□□□□□ -0.51
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