RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CARD17	Q5XLA6	110 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	VIT	Q6UXI7	678 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		Q6ZS46	218 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	VSTM4	Q8IW00	320 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NCOA7	Q8NI08	942 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GPX8	Q8TED1	209 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	OSTF1	Q92882	214 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MARC2	Q969Z3	335 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NTAN1	Q96AB6	310 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PHF21A	Q96BD5	680 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FBXO17	Q96EF6	278 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	OLFM3	Q96PB7	478 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PANX3	Q96QZ0	392 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RANBP9	Q96S59	729 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PCYT2	Q99447	389 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NDN	Q99608	321 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GPR20	Q99678	358 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GLOD4	Q9HC38	313 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SERHL	Q9NQF3	203 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PIGV	Q9NUD9	493 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GCNT4	Q9P109	453 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	C3orf18	Q9UK00	162 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF175	Q9Y473	711 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		A0A0U1RQS6	177 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398		A0A1B0GUH1	482 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398		A0A1W2PPM1	405 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PRSS38	A1L453	326 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	AIM2	O14862	343 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	ADCY6	O43306	1168 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	DYRK3	O43781	588 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	SELENOF	O60613	162 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PRAMEF2	O60811	474 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	OPHN1	O60890	802 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	ATG13	O75143	517 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	RPS6KA5	O75582	802 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	THBD	P07204	575 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CD63	P08962	238 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CCNB1	P14635	433 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	TCF4	P15884	667 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PNLIP	P16233	465 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	LBP	P18428	481 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	NR1D1	P20393	614 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	OTX2	P32243	289 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	MMP12	P39900	470 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	NAMPT	P43490	491 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	FHIT	P49789	147 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	SOX8	P57073	446 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	RAB11A	P62491	216 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CSNK1G2	P78368	415 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	BNC1	Q01954	994 aa		3.15	□□□□□ -1.91

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