RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 PPIP5K2O43314 1243 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC22A3O75751 556 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 PNPP00491 289 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 C9P02748 559 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 MT-ND3P03897 115 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
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RABGGTB-207ENST00000470201 CA9Q16790 459 aa4.36□□□□□ -1.71
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RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa4.36□□□□□ -1.71
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RABGGTB-207ENST00000470201 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 PROX1Q92786 737 aa4.36□□□□□ -1.71
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RABGGTB-207ENST00000470201 BICD1Q96G01 975 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
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RABGGTB-207ENST00000470201 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
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RABGGTB-207ENST00000470201 TRAV24A0A0B4J272 114 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1W2PRV1 198 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 MYMKA6NI61 221 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 SDR42E2A6NKP2 422 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 E9PI62 339 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-207ENST00000470201 EPORP19235 508 aa4.34□□□□□ -1.71
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RABGGTB-207ENST00000470201 KIF5AQ12840 1032 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 RPA4Q13156 261 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC39A12Q504Y0 691 aa4.34□□□□□ -1.71
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