RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 STK33Q9BYT3 514 aa3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 COQ3Q9NZJ6 369 aa3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D7Q9P0N9 293 aa3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 SEC14L3Q9UDX4 400 aa3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 CDC23Q9UJX2 597 aa3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 RARRES3Q9UL19 164 aa3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 OR51B4Q9Y5P0 310 aa3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 DSCAMO60469 2012 aa3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 HEATR5AQ86XA9 2040 aa3.93□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 VPS13CQ709C8 3753 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 IDSB3KWA1 339 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 H7C1Q1 480 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 PEX12O00623 359 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 APOL1O14791 398 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 IKBKBO14920 756 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGEF9O43307 516 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 PFKFB2O60825 505 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 PMPCBO75439 489 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 CLDN11O75508 207 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 CTAG2O75638 210 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 RASSF9O75901 435 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 SLCO2B1O94956 709 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 C9P02748 559 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 RPN1P04843 607 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 UGT2B4P06133 528 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 RAB40ALP0C0E4 278 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 IDSP22304 550 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPN7P35236 360 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 ACTR1BP42025 376 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 GSDMDP57764 484 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 ACTR1AP61163 376 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 HHEXQ03014 270 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 ELP6Q0PNE2 266 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 TUBB3Q13509 450 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 KEAP1Q14145 624 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 INAQ16352 499 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 C3AR1Q16581 482 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 CARD16Q5EG05 197 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC73Q5JTD7 316 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 RETSATQ6NUM9 610 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 MRGPREQ86SM8 312 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 ULK2Q8IYT8 1036 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 CARFQ8N187 725 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 SCML4Q8N228 414 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD53Q8N9V6 530 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 DCAF4L2Q8NA75 395 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD52Q8NB46 1076 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 OR52K2Q8NGK3 314 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC37A2Q8TED4 501 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 STON2Q8WXE9 905 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 RAD54LQ92698 747 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 SDCCAG3Q96C92 435 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 MAGED4Q96JG8 741 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 PWWP2AQ96N64 755 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 BDH2Q9BUT1 245 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 NLNQ9BYT8 704 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 IMPG2Q9BZV3 1241 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 CHST8Q9H2A9 424 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 EPS8L2Q9H6S3 715 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 WDR26Q9H7D7 661 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 CYP3A43Q9HB55 503 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR35Q9HC97 309 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 WASH6PQ9NQA3 447 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 OLFML3Q9NRN5 406 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 JKAMPQ9P055 326 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 LRFN1Q9P244 771 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF69Q9UC07 566 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 TINAGQ9UJW2 476 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 MEMO1Q9Y316 297 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 FREM1Q5H8C1 2179 aa3.92□□□□□ -1.78
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF407Q9C0G0 2248 aa3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms