RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445961.5

RPS9-208, Transcript of ribosomal protein S9, human

TSL 5

Gene RPS9, Length 944 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS9-208	ENST00000445961	IL22	Q9GZX6	179 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	P2RY12	Q9H244	342 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	BFAR	Q9NZS9	450 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	NBAS	A2RRP1	2371 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	KDM1A	O60341	852 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	SLCO2B1	O94956	709 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	VAPB	O95292	243 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	CD9	P21926	228 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	ARNT	P27540	789 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	FMO4	P31512	558 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	RAB28	P51157	221 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	PGD	P52209	483 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	TMED2	Q15363	201 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	MPP5	Q8N3R9	675 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	PRELID2	Q8N945	189 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	SCN2A	Q99250	2005 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	MASP2	O00187	686 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	AVIL	O75366	819 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	RPN2	P04844	631 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	TPSB2	P20231	275 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	GRIA3	P42263	894 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	RAPSN	Q13702	412 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	TPSAB1	Q15661	275 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	FCRL6	Q6DN72	434 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	CNST	Q6PJW8	725 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	TRIM58	Q8NG06	486 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	MIB2	Q96AX9	1013 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	MS4A14	Q96JA4	679 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	GBP5	Q96PP8	586 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	PANX3	Q96QZ0	392 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	KIFC1	Q9BW19	673 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	NUDT9	Q9BW91	350 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	EURL	Q9NYK6	297 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	GALP	Q9UBC7	116 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	SOX13	Q9UN79	622 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	TTLL8	A6PVC2	850 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	AP3B1	O00203	1094 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	RASGRF2	O14827	1237 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	C1orf105	O95561	183 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	KRT14	P02533	472 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	ALAS2	P22557	587 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23	8e-11	■■□□□ 13.1
RPS9-208	ENST00000445961	MCM3	P25205	808 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	PSMB5	P28074	263 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	GPS1	Q13098	491 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	KCNJ11	Q14654	390 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	TTC27	Q6P3X3	843 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	RAB43	Q86YS6	212 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	BIRC8	Q96P09	236 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	NDC1	Q9BTX1	674 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RPS9-208	ENST00000445961	CEACAM4	O75871	244 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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