RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 BMP8BP34820 402 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 UGT2B10P36537 528 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 DIO3P55073 304 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 BEX3Q00994 111 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RHAGQ02094 409 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXM1Q08050 763 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PAMR1Q6UXH9 720 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 AHSA2Q719I0 299 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PROSER1Q86XN7 944 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF566Q969W8 418 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TMCO6Q96DC7 493 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX37Q96LM6 180 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PCYT2Q99447 389 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 APOL4Q9BPW4 351 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNS3Q9BQ31 491 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RIBC2Q9H4K1 309 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF556Q9HAH1 456 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF6Q9Y252 685 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPB11Q9Y547 144 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 COL1A2P08123 1366 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2A25A4D2G3 310 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SMLR1H3BR10 107 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP6CO00743 305 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PIP5K1BO14986 540 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TULP3O75386 442 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 C1RP00736 705 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 NPPAP01160 153 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 HGFP14210 728 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 DDCP20711 480 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RYKP34925 604 aa8.22□□□□□ -1.09
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RABGEF1-203ENST00000439720 CA5AP35218 305 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 HAAOP46952 286 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MAN2A2P49641 1150 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNK10P57789 538 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 OSTNP61366 133 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MGAT3Q09327 533 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.22□□□□□ -1.09
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RABGEF1-203ENST00000439720 CORO6Q6QEF8 472 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.22□□□□□ -1.09
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RABGEF1-203ENST00000439720 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.22□□□□□ -1.09
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RABGEF1-203ENST00000439720 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RASSF1Q9NS23 344 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
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