RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NPBWR1P48145 328 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MMP15P51511 669 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 STARD6P59095 220 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PTENP60484 403 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IL1RL1Q01638 556 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HNF4GQ14541 408 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CALCRLQ16602 461 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LRRC38Q5VT99 294 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 Q75L30 129 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BTN2A1Q7KYR7 527 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACVR1CQ8NER5 493 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM255BQ8WV15 326 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RUNDC3BQ96NL0 473 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RUFY1Q96T51 708 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NEURL2Q9BR09 285 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRRG4Q9BZD6 226 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SRD5A3Q9H8P0 318 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PADI3Q9ULW8 664 aa4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HYKKA2RU49 373 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BECN2A8MW95 431 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CPLX1O14810 134 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FLRT2O43155 660 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PPIP5K2O43314 1243 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRPSAP2O60256 369 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACSL3O95573 720 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PLA2G2AP14555 144 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYP11B2P19099 503 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMPOP42166 694 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PSMC4P43686 418 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RPL21P46778 160 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MTCP1P56278 107 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 COG7P83436 770 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARHGAP1Q07960 439 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPS2Q13227 327 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HLFQ16534 295 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IQCCQ4KMZ1 466 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AARDQ4LEZ3 155 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATG9AQ7Z3C6 839 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC9B2Q86UD5 537 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LMNTD2Q8IXW0 634 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC44A1Q8WWI5 657 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CKAP2Q8WWK9 683 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PHF21AQ96BD5 680 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPATA33Q96N06 139 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM237Q96Q45 408 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DCLK3Q9C098 648 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MIS12Q9H081 205 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLA2Q9H6Q3 261 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GKN1Q9NS71 199 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PDRG1Q9NUG6 133 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYP39A1Q9NYL5 469 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAD2L2Q9UI95 211 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PCDHA7Q9UN72 937 aa4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRAV24A0A0B4J272 114 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FEZF1A0PJY2 475 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ILVBLA1L0T0 632 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CAPN9O14815 690 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ST8SIA3O43173 380 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCNJ13O60928 360 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RPS6KA5O75582 802 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PCP11498 1178 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IRF2P14316 349 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CSF2RAP15509 400 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TCF4P15884 667 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 S1PR1P21453 382 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TNFRSF8P28908 595 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KIF5BP33176 963 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LUMP51884 338 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC12A3P55017 1021 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NME5P56597 212 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UBASH3AP57075 661 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RPS18P62269 152 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SULT2A1Q06520 285 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TROAPQ12815 778 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRAF1Q13077 416 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF234Q14588 700 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PPA1Q15181 289 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NPTX1Q15818 432 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms