RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ZPBPQ9BS86 351 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC61Q9BV99 259 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 NDST4Q9H3R1 872 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 RDH14Q9HBH5 336 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.15□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.15□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 GTF2BQ00403 316 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 ACOT1Q86TX2 421 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 KAT5Q92993 513 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.13□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 B4E171 279 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 F5H697 171 aa6.13□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 KCNAB3O43448 404 aa6.13□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 YPEL5P62699 121 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 TLE4Q04727 773 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SULT2A1Q06520 285 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SCD5Q86SK9 330 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 FJX1Q86VR8 437 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.13□□□□□ -1.43
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