RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425660.5

ACTB-204, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-204ENST00000425660 OR4K3Q96R72 315 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 FZD3Q9NPG1 666 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 KLQ9UEF7 1012 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 EBF1Q9UH73 591 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
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ACTB-204ENST00000425660 AGKQ53H12 422 aa14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-204ENST00000425660 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-204ENST00000425660 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-204ENST00000425660 THTPAQ9BU02 230 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 SGPP1Q9BX95 441 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-204ENST00000425660 NDE1Q9NXR1 346 aa14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-204ENST00000425660 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 SNX6Q9UNH7 406 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 ASF1AQ9Y294 204 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 FFAR3O14843 346 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 AIM2O14862 343 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 GPR42O15529 346 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 RGS14O43566 566 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 ERGP11308 486 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 JUPP14923 745 aa14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-204ENST00000425660 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-204ENST00000425660 DSELQ8IZU8 1212 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 TSPEARQ8WU66 669 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 HMGB4Q8WW32 186 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 RAD51AP1Q96B01 352 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 VCANP13611 3396 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 POM121BA6NF01 834 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 E7ENX8 843 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 FBP2O00757 339 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 ATP6V1G2O95670 118 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 RPN2P04844 631 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 PRPH2P23942 346 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 TAP2Q03519 686 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 CHIT1Q13231 466 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 NR6A1Q15406 480 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.75□□□□□ -0.05
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ACTB-204ENST00000425660 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
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ACTB-204ENST00000425660 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 DEFB107AQ8IZN7 70 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 MED8Q96G25 268 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 SUFUQ9UMX1 484 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 FPGTO14772 594 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 GNAZP19086 355 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 CD22P20273 847 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 KELP23276 732 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 TBPL1P62380 186 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 IRF8Q02556 426 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 FZD5Q13467 585 aa14.74□□□□□ -0.05
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