RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM72BQ86X60 149 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 OR5K1Q8NHB7 308 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA1191Q96A73 305 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 CGREF1Q99674 301 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 EBF2Q9HAK2 575 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0D9SEW6 157 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 DPPA5A6NC42 116 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 TRMUO75648 421 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 EPGNQ6UW88 154 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 COX18Q8N8Q8 333 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4F6Q8NGB9 312 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 IGSF21Q96ID5 467 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC2A13Q96QE2 648 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF347Q96SE7 839 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 NOBOXO60393 691 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 BEST1O76090 585 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 SYN1P17600 705 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 VARSP26640 1264 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC13A2Q13183 592 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 PCLAFQ15004 111 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 ART5Q96L15 291 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 TLR9Q9NR96 1032 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 TPST2O60704 377 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 GAL3ST4Q96RP7 486 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 PRKAB1Q9Y478 270 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 GMFGO60234 142 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 POP7O75817 140 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 RFC2P35250 354 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPRCAPQ14761 206 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM131AQ6UXB0 335 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 CDADC1Q9BWV3 514 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM138Q9NPI0 162 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 PRKAR1AP10644 381 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 CLCNKAP51800 687 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 DGKQP52824 942 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 CRISP3P54108 245 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 CASP9P55211 416 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIB2Q92519 343 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 CLIC1O00299 241 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF623O75123 536 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 GDF5P43026 501 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 GINS4Q9BRT9 223 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 LEFTY2O00292 366 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 EI24O14681 340 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 SSNA1O43805 119 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 TBX10O75333 385 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR32O75388 356 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 CANT1Q8WVQ1 401 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 IL1RAPQ9NPH3 570 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM92AA1XBS5 289 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 HCN1O60741 890 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 SPIN4Q56A73 249 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM110BQ8TC76 370 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAP2Q9NPF8 381 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 PRORSD1PA6NEY8 169 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 ARPC2O15144 300 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 CDH1P12830 882 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 AOC1P19801 751 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFS1P28331 727 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 MPIP34949 423 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 CREB5Q02930 508 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms