RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 AP3D1O14617 1153 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 TBC1D4O60343 1298 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 HRH2P25021 359 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CD40LGP29965 261 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 PSMD8P48556 350 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ARPC4P59998 168 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 DAG1Q14118 895 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 LCN8Q6JVE9 175 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 OR10A6Q8NH74 314 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CASD1Q96PB1 797 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 HPS4Q9NQG7 708 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 FFAR2O15552 330 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 IDH3BO43837 385 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 RPS17P08708 135 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CSKP41240 450 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CHRNB3Q05901 458 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 Q6ZSR9 355 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 GALNT7Q86SF2 657 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM199Q8N511 208 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 RORBQ92753 470 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 SLC22A12Q96S37 553 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ENPP5Q9UJA9 477 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 UGT2B11O75310 529 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CYP7B1O75881 506 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 LRATO95237 230 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 IGLV3-27P01718 113 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 PTGER3P43115 390 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 BCL2L1Q07817 233 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ANKRD46Q86W74 232 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MICU2Q8IYU8 434 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MFSD4AQ8N468 514 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 FAM162AQ96A26 154 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CITED4Q96RK1 184 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 DPY30Q9C005 99 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 OPTCQ9UBM4 332 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 G3V2T6 193 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 DIRAS1O95057 198 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CST1P01037 141 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 VAC14Q08AM6 782 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF555Q8NEP9 628 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 PEX13Q92968 403 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 TRIM54Q9BYV2 358 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ACTR8Q9H981 624 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 C14orf119Q9NWQ9 140 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 E2F3O00716 465 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ULK1O75385 1050 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 PGLSO95336 258 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ESR1P03372 595 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 HSD17B1P14061 328 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 GJA1P17302 382 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 FAM189BP81408 668 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 USP51Q70EK9 711 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MCFD2Q8NI22 146 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 PYCR2Q96C36 320 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MATN4O95460 622 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 KRT8P05787 483 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ITGALP20701 1170 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 SUOXP51687 545 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 RCAN2Q14206 197 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 DGUOKQ16854 277 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms