RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396172.5

DDX39B-202, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX39B, Length 2,133 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-202ENST00000396172 C14orf28Q4W4Y0 310 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 ANKS6Q68DC2 871 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 OGFOD3Q6PK18 319 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 HOMEZQ8IX15 550 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 MGARPQ8TDB4 240 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 CCDC134Q9H6E4 229 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 IKZF3Q9UKT9 509 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 STK38LQ9Y2H1 464 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 UNC13CQ8NB66 2214 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 RP1P56715 2156 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 CFAP73A6NFT4 308 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 LILRA5A6NI73 299 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 A8MT66 165 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 G3V2L1 256 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 FLRT2O43155 660 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 MGRN1O60291 552 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 BPGMP07738 259 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 SERPINB5P36952 375 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 SLC19A1P41440 591 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 BNIP3Q12983 259 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 PLCL1Q15111 1095 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 PFKFB4Q16877 469 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 KLHL35Q6PF15 583 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 GPR156Q8NFN8 814 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 EPB41L1Q9H4G0 881 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 SEMA4GQ9NTN9 838 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 OXSMQ9NWU1 459 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 PROB1E7EW31 1015 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 MATN2O00339 956 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 NOBOXO60393 691 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 TRIM13O60858 407 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 EML2O95834 649 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 ERGP11308 486 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 MTHFD2P13995 350 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 GRK2P25098 689 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 PKLRP30613 574 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 GGT5P36269 586 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 GRK6P43250 576 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 PNLIPRP1P54315 467 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 EPHA4P54764 986 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 HERVK_113P63132 956 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 CCDC6Q16204 474 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 CFAP157Q5JU67 520 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 ATG16L1Q676U5 607 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 SLC25A45Q8N413 288 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 LCN9Q8WX39 176 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 DLG3Q92796 817 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 PKP4Q99569 1192 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 EDEM2Q9BV94 578 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 SIRPGQ9P1W8 387 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-202ENST00000396172 RHPN2P1A8MT19 583 aa9.58□□□□□ -0.88
DDX39B-202ENST00000396172 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
DDX39B-202ENST00000396172 DLX3O60479 287 aa9.58□□□□□ -0.88
DDX39B-202ENST00000396172 KATNA1O75449 491 aa9.58□□□□□ -0.88
DDX39B-202ENST00000396172 SLC16A8O95907 504 aa9.58□□□□□ -0.88
DDX39B-202ENST00000396172 SBK3P0C264 359 aa9.58□□□□□ -0.88
DDX39B-202ENST00000396172 IMPA1P29218 277 aa9.58□□□□□ -0.88
DDX39B-202ENST00000396172 SPEM2Q0P670 501 aa9.58□□□□□ -0.88
DDX39B-202ENST00000396172 MPP2Q14168 576 aa9.58□□□□□ -0.88
DDX39B-202ENST00000396172 GPR18Q14330 331 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms