RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 MOCOSQ96EN8 888 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 PCBD2Q9H0N5 130 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAP2Q9NPF8 381 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 MCUBQ9NWR8 336 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 PHLPP1O60346 1717 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 CBFA2T3O75081 653 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 G6PDP11413 515 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5AK3PQ8NH89 298 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 RASSF5Q8WWW0 418 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC35G5Q96KT7 338 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 CNPPD1Q9BV87 410 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCG4Q9H172 646 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAMTS10Q9H324 1103 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 INSL6Q9Y581 213 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 IL7RP16871 459 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 DAG1Q14118 895 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 GANABQ14697 944 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM92BQ6ZTR7 304 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM63Q969Q1 353 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ATXN10Q9UBB4 475 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 IL36AQ9UHA7 158 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PQY0 241 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 AXIN1O15169 862 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 INPPL1O15357 1258 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 GJB5O95377 273 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 HNMTP50135 292 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 KCT2Q8NC54 265 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5K1Q8NHB7 308 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 OMA1Q96E52 524 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 PKP2Q99959 881 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 TVP23BQ9NYZ1 205 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 INSL5Q9Y5Q6 135 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ENGP17813 658 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 CPN2P22792 545 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 MAGEA11P43364 429 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 TGFBIQ15582 683 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 NDUFA9Q16795 377 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 TREML1Q86YW5 311 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 C5orf34Q96MH7 638 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 YIPF4Q9BSR8 244 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 COPS4Q9BT78 406 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR26Q9H7D7 661 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ZIM2Q9NZV7 527 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 MEIS3P2A8K0S8 358 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 TOR1BO14657 336 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 POP7O75817 140 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 PDGFRLQ15198 375 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 CARTPTQ16568 116 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 SMARCD3Q6STE5 483 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 OR10T2Q8NGX3 314 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR62Q9BZJ7 368 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 DERL2Q9GZP9 239 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM92AA1XBS5 289 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF487B1APH4 448 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 IDH3BO43837 385 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 GALTP07902 379 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 CLCNKAP51800 687 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRC32Q14392 662 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 SERINC5Q86VE9 423 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 TP53INP2Q8IXH6 220 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 DCAF4L2Q8NA75 395 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 TSGA13Q96PP4 275 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 IRGMA1A4Y4 181 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC85CA6NKD9 419 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 EPOP01588 193 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 CCNFP41002 786 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 CDH15P55291 814 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 RELTQ969Z4 430 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ARMC5Q96C12 935 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 E7ESA3 106 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 C9P02748 559 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 TYRP14679 529 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 RPL10P27635 214 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 ECHS1P30084 290 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms