RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378402.9

PKHD1L1-201, Transcript of PKHD1 like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKHD1L1, Length 13,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1-201ENST00000378402 OTUB2Q96DC9 234 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RNFT2Q96EX2 444 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PAFAH2Q99487 392 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CBWD1Q9BRT8 395 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LRRC3Q9BY71 257 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NDFIP2Q9NV92 336 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LRP2BPQ9P2M1 347 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FBXO5Q9UKT4 447 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ERCC6L2Q5T890 1561 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ATAD5Q96QE3 1844 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 H3BMQ9 156 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MT-ND2P03891 347 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SOX11P35716 441 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RFX3P48380 749 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GATMP50440 423 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 DCAF6Q58WW2 860 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCTD8Q6ZWB6 473 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR2L8Q8NGY9 312 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCTD7Q96MP8 289 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NFKBIZQ9BYH8 718 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 THAP2Q9H0W7 228 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CAPN10Q9HC96 672 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HHATLQ9HCP6 504 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 KLHL28Q9NXS3 571 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MAP10Q9P2G4 905 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SNX24Q9Y343 169 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ADGRB1O14514 1584 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CHD4Q14839 1912 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 STARD3NLO95772 234 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ERVK-24P63145 666 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 IKBKEQ14164 716 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GUCA2BQ16661 112 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CASP12Q6UXS9 341 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 METTL13Q8N6R0 699 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR8S1Q8NH09 359 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MCMBPQ9BTE3 642 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR51M1Q9H341 326 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ADAP2Q9NPF8 381 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RASL12Q9NYN1 266 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FKBPLQ9UIM3 349 aa3.38□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAM205CA6NFA0 338 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LRRC14BA6NHZ5 514 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR5K4A6NMS3 321 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAM166BA8MTA8 275 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF263O14978 683 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TREHO43280 583 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RAB6AP20340 208 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ATP6V1B2P21281 511 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TNK1Q13470 666 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 EFCAB12Q6NXP0 572 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 DNAJC22Q8N4W6 341 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TFAP2CQ92754 450 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SCRN2Q96FV2 425 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 INPP5KQ9BT40 448 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RNF121Q9H920 327 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 C5orf51A6NDU8 294 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SEC14L2O76054 403 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GABARAPO95166 117 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 IFNB1P01574 187 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HEXBP07686 556 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CYP21A2P08686 494 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ACO1P21399 889 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ATP5OP48047 213 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ENTPD1P49961 510 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 AQP4P55087 323 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RAP1BP61224 184 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ROR1Q01973 937 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GFOD2Q3B7J2 385 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM200AQ86VY9 491 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FBXO36Q8NEA4 188 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RDM1Q8NG50 284 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RSC1A1Q92681 617 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RSPRY1Q96DX4 576 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR52B2Q96RD2 323 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC9A7Q96T83 725 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FEM1AQ9BSK4 669 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LRFN3Q9BTN0 628 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TEX101Q9BY14 249 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 WWTR1Q9GZV5 400 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms