RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367094.6

TULP4-201, Transcript of tubby like protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TULP4, Length 5,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4-201ENST00000367094 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 PRAMEF11O60813 436 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 ECI2O75521 394 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 H6PDO95479 791 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 ANXA8P13928 327 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 CCR10P46092 362 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 CLCN2P51788 898 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 GALNT7Q86SF2 657 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TMEM17Q86X19 198 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 OXR1Q8N573 874 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 CAPNS2Q96L46 248 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TCF25Q9BQ70 676 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 SLC32A1Q9H598 525 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.99□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 PPEF2O14830 753 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 DLX3O60479 287 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 SCN2BO60939 215 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 ARPC4P59998 168 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TMEM220Q6QAJ8 160 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 SLC34A3Q8N130 599 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 KIAA1191Q96A73 305 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 PEBP4Q96S96 227 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 FIZ1Q96SL8 496 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 DUSP26Q9BV47 211 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 EBF2Q9HAK2 575 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 GIN1Q9NXP7 522 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 FAM172BPA6NC97 362 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 PROZP22891 400 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 S100A2P29034 98 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 AQP4P55087 323 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 RING1Q06587 406 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 SCAPQ12770 1279 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 KCNC3Q14003 757 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 MSS51Q4VC12 460 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 PAQR3Q6TCH7 311 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 THRSPQ92748 146 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 PRRG4Q9BZD6 226 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 COMMD4Q9H0A8 199 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 MKLN1Q9UL63 735 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 MYH3P11055 1940 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 ITM2AO43736 263 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 AHSGP02765 367 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 CHRNA4P43681 627 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 DNASE1L1P49184 302 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 IL18Q14116 193 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 EIPR1Q53HC9 387 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 ZNF730Q6ZMV8 503 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 LINC00471Q8N535 108 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 DCAF4L2Q8NA75 395 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 OR10A6Q8NH74 314 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 PIGXQ8TBF5 258 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 LRRC58Q96CX6 371 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 RNF39Q9H2S5 420 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 ZBTB26Q9HCK0 441 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 MLXQ9UH92 298 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 DPPA5A6NC42 116 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 LRRC72A6NJI9 287 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 CCL22O00626 93 aa9.98□□□□□ -0.81
TULP4-201ENST00000367094 EPHX1P07099 455 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms