RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359276.8

CTPS2-201, Transcript of CTP synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTPS2, Length 3,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2-201ENST00000359276 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 PCP4L1A6NKN8 68 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 OR1I1O60431 355 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 ULK1O75385 1050 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 SNX4O95219 450 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 B3GALT4O96024 378 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 IL18R1Q13478 541 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 TSTQ16762 297 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 FAM187BQ17R55 369 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 RGMBQ6NW40 437 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 CDADC1Q9BWV3 514 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 TEX28O15482 410 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 CD6P30203 668 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 FCHO2Q0JRZ9 810 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 NATD1Q8N6N6 113 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 TMEM30AQ9NV96 361 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 PCTPQ9UKL6 214 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 HSPB11Q9Y547 144 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 MAU2Q9Y6X3 613 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 E9PAM4 449 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 PCDHGA12O60330 932 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 UQCRC1P31930 480 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 ADCYAP1R1P41586 468 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 SCAPQ12770 1279 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 DNAJB3Q8WWF6 145 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 TMCO6Q96DC7 493 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 ZNF225Q9UK10 706 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 RFXANKO14593 260 aa16.08■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 FABP3P05413 133 aa16.08■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 SCNN1GP51170 649 aa16.08■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 CPZQ66K79 652 aa16.08■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 KLHL17Q6TDP4 642 aa16.08■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 PAMR1Q6UXH9 720 aa16.08■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 LBX2Q6XYB7 198 aa16.08■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 AMIGO1Q86WK6 493 aa16.08■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 CDCA5Q96FF9 252 aa16.08■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 TSGA13Q96PP4 275 aa16.08■□□□□ 0.17
CTPS2-201ENST00000359276 H3BM21 787 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 RGS13O14921 159 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 TREHO43280 583 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 RGS14O43566 566 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 RPP40O75818 363 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 P2RX3P56373 397 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 GPLD1P80108 840 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 ST3GAL4Q11206 333 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 NPRL3Q12980 569 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 PYDC2Q56P42 97 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 NOXA1Q86UR1 476 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 PHF21AQ96BD5 680 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 CCDC120Q96HB5 630 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 BCL7BQ9BQE9 202 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 RAD18Q9NS91 495 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 PIRO00625 290 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 SEMA3DO95025 777 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 GALK2Q01415 458 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 ARHGEF7Q14155 803 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 OVOS1Q6IE37 1185 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 OR8J3Q8NGG0 315 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 OR8H1Q8NGG4 311 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 MYLPFQ96A32 169 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 SMARCD1Q96GM5 515 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 SLC52A3Q9NQ40 469 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 BTAF1O14981 1849 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 OR2A25A4D2G3 310 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 SLC16A6O15403 523 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 SCO1O75880 301 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 B3GAT3O94766 335 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 NPPAP01160 153 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 WEE1P30291 646 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 SSTR4P31391 388 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 TNFSF8P32971 234 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 NFKB2Q00653 900 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 ZMAT1Q5H9K5 638 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 KIAA0319Q5VV43 1072 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS2-201ENST00000359276 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms