RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 NAP1L6A6NFF2 107 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 NOBOXO60393 691 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 LAMP2P13473 410 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 IL32P24001 234 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 HTR1BP28222 390 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 TSPAN5P62079 268 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 NPTX1Q15818 432 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 LINGO2Q7L985 606 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 EDEM1Q92611 657 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ZUFSPQ96AP4 578 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 PPA2Q9H2U2 334 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 NME7Q9Y5B8 376 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 COL1A2P08123 1366 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 SSX4O60224 188 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 CHMP24386 653 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 GNASQ5JWF2 1037 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ASRGL1Q7L266 308 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 OR5T3Q8NGG3 340 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 OR52B2Q96RD2 323 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 SPG21Q9NZD8 308 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 OR12D3Q9UGF7 316 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGEB17A8MXT2 336 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 FMO3P31513 532 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 TAS2R40P59535 323 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTA2P62736 377 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTG2P63267 376 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 PON2Q15165 354 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 DET1Q7L5Y6 550 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 PDZD9Q8IXQ8 264 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA6LQ8N4H0 392 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 OR7G1Q8NGA0 311 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 BPIFB1Q8TDL5 484 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 NEK7Q8TDX7 302 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ING5Q8WYH8 240 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 UQCC2Q9BRT2 126 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 GBA3Q9H227 469 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 GAS6Q14393 721 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 STON2Q8WXE9 905 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 MOAP1Q96BY2 351 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 MTMR9Q96QG7 549 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ABCG8Q9H221 673 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 C5orf51A6NDU8 294 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 NUDT7P0C024 238 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP5CP53041 499 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTBP60709 375 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTG1P63261 375 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP3CAQ08209 521 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 DAG1Q14118 895 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 SNX27Q96L92 541 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 DNMT3LQ9UJW3 386 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD63C9JTQ0 380 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 RENP00797 406 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 MATN1P21941 496 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf186Q6ZWK4 172 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 SACM1LQ9NTJ5 587 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 STK16O75716 305 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 VTNP04004 478 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 RYKP34925 604 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 TAS2R31P59538 309 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 C17orf64Q86WR6 236 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC52Q8N7C0 313 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2L2Q8NH16 312 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAJC19Q96DA6 116 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 TTYH2Q9BSA4 534 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB9BQ9NP90 201 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 GTF2F2P13984 249 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ERVK-8P63133 956 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 SHC3Q92529 594 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHAC1Q9H158 963 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 WASF3Q9UPY6 502 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms