RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 FUNDC2Q9BWH2 189 aa20.49■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 C1orf109Q9NX04 203 aa20.49■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa20.49■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 XYLBO75191 536 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CLPXO76031 633 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 EBLN1P0CF75 366 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ACRV1P26436 265 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 HNF1BP35680 557 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 NRIP1P48552 1158 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ISL1P61371 349 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 RAB33AQ14088 237 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 Q6ZNB5 142 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 DCDC5Q6ZRR9 648 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ITCHQ96J02 903 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 INPP5KQ9BT40 448 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CRLS1Q9UJA2 301 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 C3orf18Q9UK00 162 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 BLOC1S6Q9UL45 172 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 TRBC1P01850 177 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 URODP06132 367 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 RETP07949 1114 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 BPIP17213 487 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CA8P35219 290 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 SPCS2Q15005 226 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CHRNA6Q15825 494 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 SMU1Q2TAY7 513 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 OR5K1Q8NHB7 308 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 FKBP10Q96AY3 582 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF558Q96NG5 402 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ACPTQ9BZG2 426 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC90BQ9GZT6 254 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 BAG5Q9UL15 447 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 BNIP3LO60238 219 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CBFA2T3O75081 653 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 STK16O75716 305 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 WDR47O94967 919 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CKMP06732 381 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 HTR1BP28222 390 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 AQP6Q13520 282 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ATP1A4Q13733 1029 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 SPIDRQ14159 915 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 NR1D2Q14995 579 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ATG9BQ674R7 924 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 OR52E4Q8NGH9 312 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 USP7Q93009 1102 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 IL21Q9HBE4 155 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 SERHLQ9NQF3 203 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC1A7O00341 560 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 INMTO95050 263 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 LATS1O95835 1130 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF12P17014 697 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 GABARAPL2P60520 117 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ABCG8Q9H221 673 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 PARVBQ9HBI1 364 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 SNX5Q9Y5X3 404 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 GFRA2O00451 464 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 PDYNP01213 254 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 OCM2P0CE71 109 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 GABRR2P28476 465 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 NEK2P51955 445 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 RPS14P62263 151 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 LAPTM4AQ15012 233 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF691Q5VV52 312 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CES5AQ6NT32 575 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 GALNT5Q7Z7M9 940 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CALHM3Q86XJ0 350 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 GALNT13Q8IUC8 556 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CENPSQ8N2Z9 138 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ARL10Q8N8L6 244 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 UBTD2Q8WUN7 234 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 MUL1Q969V5 352 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 TSSK3Q96PN8 268 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 NODALQ96S42 347 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 ASIC5Q9NY37 505 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-201ENST00000308020 VNN3Q9NY84 501 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms