RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299295.6

CHODL-201, Transcript of chondrolectin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHODL, Length 2,548 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHODL-201ENST00000299295 GPRC5BQ9NZH0 403 aa21.52■■□□□ 1.04
CHODL-201ENST00000299295 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CHODL-201ENST00000299295 RYKP34925 604 aa21.52■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 MAGEA11P43364 429 aa21.52■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 IRF5Q13568 498 aa21.52■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 PIK3C3Q8NEB9 887 aa21.52■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 EGLN2Q96KS0 407 aa21.52■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 CD244Q9BZW8 370 aa21.52■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 TNKS2Q9H2K2 1166 aa21.52■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 KRT87PA6NCN2 255 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 MANBAO00462 879 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 PRAMEF1O95521 474 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 CD9P21926 228 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 CACNG1Q06432 222 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ADCK1Q86TW2 530 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 CLPBQ9H078 707 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 AQP9O43315 295 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 RETP07949 1114 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 CCDC159P0C7I6 412 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ARHGEF7Q14155 803 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 CARTPTQ16568 116 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ZNF540Q8NDQ6 660 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 SLC35B4Q969S0 331 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ULK4Q96C45 1275 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 BTBD2Q9BX70 525 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ACPTQ9BZG2 426 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ATAD3AQ9NVI7 634 aa21.51■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 GLUD1P00367 558 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ATF6P18850 670 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 GKP32189 559 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 GSSP48637 474 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 GATMP50440 423 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 SREBF2Q12772 1141 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 CLCA4Q14CN2 919 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 DOK6Q6PKX4 331 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 VTCN1Q7Z7D3 282 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 P2RY8Q86VZ1 359 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 CALHM3Q86XJ0 350 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 RNF175Q8N4F7 328 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 YIPF6Q96EC8 236 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 TM6SF2Q9BZW4 377 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 NBNO60934 754 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 TGM1P22735 817 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 SLC35A2P78381 396 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 HIPK1Q86Z02 1210 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 VMP1Q96GC9 406 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 SH3GL1Q99961 368 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ASB8Q9H765 288 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 PPT2Q9UMR5 302 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 OARD1Q9Y530 152 aa21.5■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 K7ERQ8 282 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 SLC28A1O00337 649 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 PDYNP01213 254 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 KCNA10Q16322 511 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 PAGE2Q7Z2X7 111 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 PLPP6Q8IY26 295 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 FBLIM1Q8WUP2 373 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 PYCR2Q96C36 320 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 PARVBQ9HBI1 364 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 LATS2Q9NRM7 1088 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 VWA8A3KMH1 1905 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 FAM220BPB1ANY3 271 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 H7C0S8 307 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 LCKP06239 509 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ACVR2AP27037 513 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 SLC11A2P49281 568 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 C5orf22Q49AR2 442 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 NCEH1Q6PIU2 408 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 GIN1Q9NXP7 522 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 GMPPBQ9Y5P6 360 aa21.49■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 KDM1AO60341 852 aa21.48■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 IGHA2P01877 340 aa21.48■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 PAX3P23760 479 aa21.48■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 RPS14P62263 151 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 FAM189BP81408 668 aa21.48■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 ATG9BQ674R7 924 aa21.48■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 TRIM46Q7Z4K8 759 aa21.48■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 SLC22A16Q86VW1 577 aa21.48■■□□□ 1.03
CHODL-201ENST00000299295 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms