RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298466.9

SOHLH1-201, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-201ENST00000298466 EXT2Q93063 718 aa21.52■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 PPM1MQ96MI6 270 aa21.52■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 GSAPA4D1B5 854 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 HIST1H2ADP20671 130 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 SPIDRQ14159 915 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 TGFBIQ15582 683 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 FBXO48Q5FWF7 155 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 SNAP47Q5SQN1 464 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 IRGCQ6NXR0 463 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 SUSD1Q6UWL2 747 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 FRA10AC1Q70Z53 315 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 TGM7Q96PF1 710 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 HIST1H2AJQ99878 128 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 H2AFJQ9BTM1 129 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 OR6C2Q9NZP2 312 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 RNF112Q9ULX5 631 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 OARD1Q9Y530 152 aa21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 D6RAR5 112 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 ZW10O43264 779 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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SOHLH1-201ENST00000298466 IMPA1P29218 277 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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SOHLH1-201ENST00000298466 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM92BQ6ZTR7 304 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa21.5■■□□□ 1.03
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SOHLH1-201ENST00000298466 OOSP2Q86WS3 158 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 MARCH9Q86YJ5 346 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM20CQ8IXL6 584 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 CCDC138Q96M89 665 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 ATG10Q9H0Y0 220 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 CREB1P16220 341 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 ID4P47928 161 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 PDX1P52945 283 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 C16orf46Q6P387 395 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 GPSM1Q86YR5 675 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 SYTL1Q8IYJ3 562 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 STAG3L4Q8TBR4 150 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 ACMSDQ8TDX5 336 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 CABS1Q96KC9 395 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 ATOH8Q96SQ7 321 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 TRIM54Q9BYV2 358 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 SEMA6CQ9H3T2 930 aa21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 TMEM216Q9P0N5 145 aa21.5■■□□□ 1.03
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SOHLH1-201ENST00000298466 E7ENX8 843 aa21.49■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 AGPSO00116 658 aa21.49■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 PNLIPRP1P54315 467 aa21.49■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 YBX1P67809 324 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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SOHLH1-201ENST00000298466 CYP2A13Q16696 494 aa21.49■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 HES3Q5TGS1 186 aa21.49■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 ANKS6Q68DC2 871 aa21.49■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 KLC3Q6P597 504 aa21.49■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 KLHL35Q6PF15 583 aa21.49■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 OR2L8Q8NGY9 312 aa21.49■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 VIPAS39Q9H9C1 493 aa21.49■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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SOHLH1-201ENST00000298466 PIPSLA2A3N6 862 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 A8MU76 341 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 UBXN8O00124 270 aa21.48■■□□□ 1.03
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SOHLH1-201ENST00000298466 COL6A2P12110 1019 aa21.48■■□□□ 1.03
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SOHLH1-201ENST00000298466 PRKAA1Q13131 559 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 SQSTM1Q13501 440 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 AGTRAPQ6RW13 159 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 RCBTB1Q8NDN9 531 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 PYCR2Q96C36 320 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 SCYL1Q96KG9 808 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 EGFL8Q99944 293 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 ACAT2Q9BWD1 397 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 EPB41L1Q9H4G0 881 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 ACTR10Q9NZ32 417 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 FREM2Q5SZK8 3169 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 A0A1W2PPV9 198 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM149AA5PLN7 773 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM221BA6H8Z2 402 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 TK2O00142 265 aa21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1-201ENST00000298466 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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