RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TRIM64CA6NLI5 447 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SOBPA7XYQ1 873 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 FFAR2O15552 330 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 PGFP49763 221 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 PYURFQ96I23 114 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 LDB2O43679 373 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 GUCY1B2O75343 617 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 B3GALT4O96024 378 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 IL12RB1P42701 662 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SLC15A1P46059 708 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 IFITM3Q01628 133 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 KDELC1Q6UW63 502 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 MYDGFQ969H8 173 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ZNF583Q96ND8 569 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ATG10Q9H0Y0 220 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 F8W810 466 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 RHOQP17081 205 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ITIH1P19827 911 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 HUNKP57058 714 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 RHOAP61586 193 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ELP6Q0PNE2 266 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 CCL15Q16663 113 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SLC35B4Q969S0 331 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 VPS35Q96QK1 796 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TINF2Q9BSI4 451 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 DERL2Q9GZP9 239 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.96□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TCRBV5S2A0A599 114 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 TNFRSF1BP20333 461 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CDH12P55289 794 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ZXDBP98169 803 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 RAB43Q86YS6 212 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 SLC34A3Q8N130 599 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CARNMT1Q8N4J0 409 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 IGSF8Q969P0 613 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 TMEM203Q969S6 136 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 OR51E2Q9H255 320 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CACNA1CQ13936 2221 aa14.96□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 DYRK3O43781 588 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 STSP08842 583 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 EPHA2P29317 976 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ADRA1AP35348 466 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 MED8Q96G25 268 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 KLHL3Q9UH77 587 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 PDHXO00330 501 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 FPGTO14772 594 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 OR1E2P47887 323 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 Q6ZSR9 355 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 DENND1CQ8IV53 801 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 GPR65Q8IYL9 337 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.6 ms