RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ADPRHP54922 357 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC6AQ6EIG7 209 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 NCEH1Q6PIU2 408 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA19Q7Z5L4 167 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 DHRSXQ8N5I4 330 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC58Q96CX6 371 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 MGME1Q9BQP7 344 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 H0YAE9 185 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 AZIN1O14977 448 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFS2O75306 463 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 RENBPP51606 427 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 KANK2Q63ZY3 851 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 GDPD4Q6W3E5 623 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 SPPL2CQ8IUH8 684 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM131CQ96AQ9 280 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 THAP11Q96EK4 314 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPBAP1Q96EW2 488 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPA12BQ96MM6 686 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 SMOC1Q9H4F8 434 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ALG9Q9H6U8 611 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM74BQ9NUR3 256 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf96A6NNT2 1141 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 GIPC1O14908 333 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 AURKAO14965 403 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA4FO95754 770 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ITPKAP23677 461 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A2P23975 617 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 OXTRP30559 389 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEA8P43361 318 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 DSC2Q02487 901 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ITKQ08881 620 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 OGFOD2Q6N063 350 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM74Q86UV6 250 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM73Q86UV7 250 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD49Q8WVL7 239 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3GLB1Q9Y371 365 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 MROH6A6NGR9 719 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ARPC2O15144 300 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 NOL3O60936 208 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 NPPAP01160 153 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ENTPD1P49961 510 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMG2Q02383 582 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf72Q14CZ0 275 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF805Q5CZA5 627 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA3CQ99985 751 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC39A3Q9BRY0 314 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PFDN4Q9NQP4 134 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ITM2BQ9Y287 266 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 FADS3Q9Y5Q0 445 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 FXYD1O00168 92 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ACOX3O15254 700 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 S1PR4O95977 384 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGB7P26010 798 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRNA4P43681 627 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 STT3AP46977 705 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
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CAPNS1-201ENST00000246533 PPP2CAP67775 309 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS6KA2Q15349 733 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC36A4Q6YBV0 504 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TWIST2Q8WVJ9 160 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 HDAC10Q969S8 669 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 C3orf30Q96M34 536 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC68Q9H2F9 335 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CMTM6Q9NX76 183 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF639Q9UID6 485 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 FZD4Q9ULV1 537 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SPINT1O43278 529 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 FDXRP22570 491 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SUOXP51687 545 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF789Q5FWF6 425 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PDPRQ8NCN5 879 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 OR13J1Q8NGT2 312 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SUV39H2Q9H5I1 410 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 OAZ3Q9UMX2 235 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PP18 115 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BMQ9 156 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6AP2O75787 350 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK14O94921 469 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 GNAO1P09471 354 aa25.67■■□□□ 1.7
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