RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243103.3

HOXC12-201, Transcript of homeobox C12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC12, Length 3,335 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12-201ENST00000243103 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 MIOSQ9NXC5 875 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 VNN3Q9NY84 501 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SIPA1L1O43166 1804 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 B8ZZF3 427 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SLC22A2O15244 555 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PTTG1O95997 202 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 KRT6AP02538 564 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 KRT6BP04259 564 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PROZP22891 400 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SNAPC1Q16533 368 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 METTL23Q86XA0 190 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 METTL6Q8TCB7 284 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 VMP1Q96GC9 406 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 NUMA1Q14980 2115 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 H0YAE9 185 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PCMT1P22061 227 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 GKP32189 559 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SOX3P41225 446 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PIK3CBP42338 1070 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 HTR6P50406 440 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 RAB8AP61006 207 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 RUNX1T1Q06455 604 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PTPRRQ15256 657 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 GRIK4Q16099 956 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 DPYSL2Q16555 572 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 UGP2Q16851 508 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SCML1Q9UN30 329 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 A0A1W2PP18 115 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 BTN3A1O00481 513 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PEPDP12955 493 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 CCR1P32246 355 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 NNMTP40261 264 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ZXDBP98169 803 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 QPRTQ15274 297 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 DNASE1L2Q92874 299 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 OPN1SWP03999 348 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PROS1P07225 676 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 TNNI3P19429 210 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ETV3P41162 512 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 BRCC3P46736 316 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 NRIP1P48552 1158 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PRIM2P49643 509 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SEMG2Q02383 582 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 RPA4Q13156 261 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 GPR65Q8IYL9 337 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 FBXL6Q8N531 539 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SNX18Q96RF0 628 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 APOL5Q9BWW9 433 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ITPAQ9BY32 194 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 IMPAD1Q9NX62 359 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 DSCR3O14972 297 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 NPHS1O60500 1241 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 TSPAN1O60635 241 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 NBNO60934 754 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PDGFAP04085 211 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 HSD17B1P14061 328 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 EFR3AQ14156 821 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 RFX4Q33E94 735 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 LRRC3Q9BY71 257 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 MMP27Q9H306 513 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 IGSF5Q9NSI5 407 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 GLTPQ9NZD2 209 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms