RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 GTF2H4Q92759 462 aa16.37■□□□□ 0.21
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CTDP1-201ENST00000075430 LYSMD2Q8IV50 215 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDP1-201ENST00000075430 GKN1Q9NS71 199 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDP1-201ENST00000075430 GIMAP4Q9NUV9 329 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDP1-201ENST00000075430 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CTDP1-201ENST00000075430 TTC34A8MYJ7 566 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDP1-201ENST00000075430 CCRL2O00421 344 aa16.35■□□□□ 0.21
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