RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc32a1O35633 525 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tpst1O70281 370 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P06324 132 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GzmcP08882 248 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc153P0C7Q1 202 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TfamP40630 243 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccr7P47774 378 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp39Q3TIX9 564 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc25a51Q5HZI9 298 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam71bQ5STT6 665 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NkaplQ5SZT7 395 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CcnhQ61458 323 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpl10Q6ZWV3 214 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Proser3Q7TSA6 634 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbbp8Q80YR6 893 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fignl1Q8BPY9 683 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cldn34b2Q9D9N2 209 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CercamA3KGW5 592 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aldoart2A6ZI47 364 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10718D3Z1I7 227 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r238E9Q373 306 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tex16F6WNY1 1150 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm6502L7N456 481 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sult3a1O35403 293 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnn4O89109 425 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cpa3P15089 417 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SqleP52019 572 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rhox11Q810N8 206 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psd4Q8BLR5 1005 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MylipQ8BM54 445 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Actr8Q8R2S9 624 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr342Q8VGK7 312 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd209eQ91ZW7 208 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc35a5Q921R7 437 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ggt7Q99JP7 662 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spz1Q99MY0 378 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prl7c1Q9CRB5 251 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gsdmdc1Q9D8T2 487 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zbp1Q9QY24 411 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rp1l1Q8CGM2 1859 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kntc1Q8C3Y4 2207 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Glipr1l3A0A1W2P7V2 236 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700011I03RikE9PYL8 271 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp558E9Q1J0 407 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r54K7N649 806 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lhx8O35652 367 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cldn2O88552 230 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AprtP08030 180 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf703P0CL69 594 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Upp1P52624 311 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp4b1Q64462 511 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8C4P0 716 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc29a4Q8R139 528 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gorasp1Q91X51 446 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PrkxQ922R0 355 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gemin6Q9CX53 166 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uba7Q9DBK7 977 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Inpp5aE9QAS7 422 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sult2b1O35400 338 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdh1P09803 884 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ephx2P34914 554 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nanos3P60324 178 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnab3P97382 249 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ChatQ03059 641 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DtlQ3TLR7 729 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtcap2Q5RL79 136 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zdhhc20Q5Y5T1 380 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gngt2Q61017 69 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nqo1Q64669 274 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc25a23Q6GQS1 467 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Otud6aQ6IE21 290 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ikzf5Q8BU00 419 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bdh2Q8JZV9 245 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r214Q8R279 367 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r33Q8R2E0 305 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pex19Q8VCI5 299 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Coro6Q920M5 471 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pwp1Q99LL5 501 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Col25a1Q99MQ5 666 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrps18bQ99N84 254 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hnrnpa0Q9CX86 305 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olig2Q9EQW6 323 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clec1bQ9JL99 229 aa20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm7792A0A0J9YU01 481 aa20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spin2gA0A0N4SW15 236 aa20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3183D3YUJ6 481 aa20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3139J3QK78 481 aa20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm16427J3QN52 483 aa20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spin2eJ3QNQ0 234 aa20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3106J3QPH3 481 aa20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc16a8O35308 492 aa20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Angpt2O35608 496 aa20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dsc3P55850 896 aa20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CdonQ32MD9 1250 aa20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem184cQ3TPR7 525 aa20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ube2r2Q6ZWZ2 238 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.9 ms