RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000079702.3

Cbx1-202, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cntn1P12960 1020 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Eno3P21550 434 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pdha2P35487 391 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fgf11P70378 225 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm5460Q3UQ97 254 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 AbrQ5SSL4 859 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 JrkQ60976 557 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ifi47Q61635 420 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 BegainQ68EF6 600 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 NfascQ810U3 1240 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Znf76Q8BMU0 568 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PstkQ8BP74 359 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Bicd1Q8BR07 835 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 ItpkaQ8R071 459 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Usb1Q91W78 267 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem186Q9CR76 216 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Arl13aQ9D416 372 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dnase1l1Q9D7J6 314 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Reg4Q9D8G5 157 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dda1Q9D9Z5 102 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PdclQ9DBX2 301 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rasgrp2Q9QUG9 608 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Copg2Q9QXK3 871 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Actl7aQ9QY84 440 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CasrQ9QY96 1079 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CenphQ9QYM8 241 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 EcsitQ9QZH6 435 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Angptl3Q9R182 455 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rfwd2Q9R1A8 733 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Snx1Q9WV80 522 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa11.71□□□□□ -0.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Usp24B1AY13 2617 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dchs2A0A0A6YW72 3346 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 AcacaQ5SWU9 2345 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tbc1d16A2ABG4 766 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pgm2A2CEK3 580 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm6880A3KG45 208 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SrsxB2RZI1 361 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mroh5E9PUJ8 762 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zfp788E9Q980 884 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rnf148G3X9R7 316 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr611K7N609 323 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr612L7N462 323 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tcn2O88968 430 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Il6raP22272 460 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Il1rnP25085 178 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sstr1P30873 391 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nkx2-6P43688 289 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zic1P46684 447 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Hrh1P70174 488 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc9a3r1P70441 355 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem207P86045 143 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Polr2cP97760 275 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm1123Q1RME4 390 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 ItpripQ3TNL8 555 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nt5c3bQ3UFY7 300 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Spata13Q5DU57 656 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Osbp2Q5QNQ6 908 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pik3r3Q64143 461 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Doxl2Q6IMK7 723 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1134Q7TR43 312 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kirrel2Q7TSU7 700 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kcng4Q80XM3 506 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 TxlngQ8BHN1 524 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 B430218F22RikQ8BQR5 223 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cdk5rap1Q8BTW8 588 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zfp398Q8BV16 643 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gpr152Q8BXS7 511 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SntnQ8C9X1 147 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 TwnkQ8CIW5 685 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccm2Q8K2Y9 453 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trpv3Q8K424 791 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Snx11Q91WL6 271 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fam76aQ922G2 307 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gimap4Q99JY3 219 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ilf2Q9CXY6 390 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 5530400C23RikQ9D3I0 173 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc52a3Q9D6X5 460 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmigd1Q9D7L8 261 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pfn3Q9DAD6 137 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fam13cQ9DBR2 601 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cngb3Q9JJZ9 694 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 XkQ9QXY7 446 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Bmp10Q9R229 421 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Oc90Q9Z0L3 485 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fem1aaQ9Z2G1 654 aa11.7□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fndc7A2AED3 737 aa11.69□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem236A2ARJ3 344 aa11.69□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slfn9B1ARD6 910 aa11.69□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Chst13D3Z6E3 336 aa11.69□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm3298E9PW80 205 aa11.69□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm2237E9Q501 211 aa11.69□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm3591K7N6X2 186 aa11.69□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc6a2O55192 617 aa11.69□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Grap2O89100 322 aa11.69□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Phxr1P15973 60 aa11.69□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ptgs1P22437 602 aa11.69□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Crabp2P22935 138 aa11.69□□□□□ -0.54
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CatP24270 527 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.3 ms