RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040676.10

Ankrd54-201, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd54, Length 1,904 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Lair1Q8BG84 263 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slc43a1Q8BSM7 564 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Casp9Q8C3Q9 454 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Galnt13Q8CF93 556 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Znf628Q8CJ78 1038 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slc8a2Q8K596 921 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cd207Q8VBX4 331 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tmem168Q91VX9 697 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ms4a10Q99N03 267 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mrpl17Q9D8P4 176 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Atp6ap1Q9R1Q9 463 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gsk3bQ9WV60 420 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm43302L7N1X8 611 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm3488M0QW81 238 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ackr2O08707 378 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 BdnfP21237 249 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Csf2rbP26955 896 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Chrm4P32211 479 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gbp10Q000W5 611 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Sox4Q06831 440 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gas6Q61592 674 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Pfkfb4Q6DTY7 469 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Fam149b1Q6NSV7 578 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Psmd11Q8BG32 422 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kiaa1671Q8BRV5 308 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Bend7Q8BSV3 434 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rbms3Q8BWL5 431 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Txndc11Q8K2W3 948 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Macrod1Q922B1 323 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ubox5Q925F4 539 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 PyglQ9ET01 850 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Sema4fQ9Z123 777 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Chek2Q9Z265 546 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Chd3B1AR17 2055 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 P06324 132 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 TfamP40630 243 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gpx3P46412 226 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Eps8Q08509 821 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Alg6Q3TAE8 507 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Axdnd1Q3UZ57 424 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 B130006D01RikQ8BRH6 153 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 AgmoQ8BS35 447 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kctd11Q8K485 232 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Hid1Q8R1F6 788 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Actr8Q8R2S9 624 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Pdia5Q921X9 517 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gstt3Q99L20 241 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Nck1Q99M51 377 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 DenrQ9CQJ6 198 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 HaghlQ9DB32 283 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 PrelpQ9JK53 378 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Dlgap4B1AZP2 992 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm8444F6XS56 118 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Vmn2r4K7N784 913 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gli1P47806 1111 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ap2m1P84091 435 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cyb5d1Q5NCY3 228 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Bpifb1Q61114 474 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cpsf6Q6NVF9 551 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Dcaf13Q6PAC3 445 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Wfikkn2Q7TQN3 571 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 LctlQ8K1F9 566 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 SuoxQ8R086 546 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Abhd4Q8VD66 342 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Nrip2Q9JHR9 270 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Upk3aQ9JKX8 287 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Dnaja2Q9QYJ0 412 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Angptl2Q9R045 493 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Clic1Q9Z1Q5 241 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 CroccQ8CJ40 2009 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm35911A0A1D5RLS7 214 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Maml3D4QGC2 1135 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Zfp275G3X904 499 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Lrig1P70193 1091 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cd80Q00609 306 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Olfr381Q5SSP0 311 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Klf4Q60793 483 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Larp4bQ6A0A2 741 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cd99l2Q8BIF0 237 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Efemp1Q8BPB5 493 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slc29a4Q8R139 528 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Nudt7Q99P30 236 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Zswim1Q9CWV7 455 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Toe1Q9D2E2 511 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1700086D15RikQ9D9E9 151 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gtf2h2Q9JIB4 396 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cldn8Q9Z260 225 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ccdc120A2AEV7 629 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 AccsA2AIG8 502 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Zfp964B2RR88 472 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm2956E9PVJ0 216 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 JunbP09450 344 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Hnrnpa1P49312 320 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Polr1bP70700 1135 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Prss57Q14B24 284 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Dnajc11Q5U458 559 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ssr4Q62186 172 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slc13a5Q67BT3 572 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.8 ms