RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NECAP1-222	ENST00000640072	ZSCAN26	Q16670	478 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NECAP1-222	ENST00000640072	TRIM74	Q86UV6	250 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NECAP1-222	ENST00000640072	TRIM73	Q86UV7	250 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NECAP1-222	ENST00000640072	PAF1	Q8N7H5	531 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NECAP1-222	ENST00000640072	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NECAP1-222	ENST00000640072	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NECAP1-222	ENST00000640072	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.24
NECAP1-222	ENST00000640072	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	NCAPD3	P42695	1498 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	HIP1R	O75146	1068 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	VDR	P11473	427 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	TRIM29	Q14134	588 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	TEX35	Q5T0J7	233 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	BICDL2	A1A5D9	508 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	PSME1	Q06323	249 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	LCA5	Q86VQ0	697 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	TRIM11	Q96F44	468 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	IL16	Q14005	1332 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	PPFIA2	O75334	1257 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	MAP2K2	P36507	400 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	PTPRO	Q16827	1216 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	MPP4	Q96JB8	637 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A1B0GUL7	405 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	TIMM44	O43615	452 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	C8orf34	Q49A92	452 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	C17orf50	Q8WW18	174 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	GPS2	Q13227	327 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	E2F4	Q16254	413 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	FOSL1	P15407	271 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	CA8	P35219	290 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	LONRF1	Q17RB8	773 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	MAGEA8	P43361	318 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	MCM6	Q14566	821 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	VMP1	Q96GC9	406 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	POM121	Q96HA1	1249 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	CRBN	Q96SW2	442 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072		A6NJR5	290 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	TGFB3	P10600	412 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	CD53	P19397	219 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	WIZ	O95785	1651 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NECAP1-222	ENST00000640072	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms