RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638876.1

SLC35A3-211, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC35A3, Length 1,005 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-211ENST00000638876 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.2■■■□□ 2.26
SLC35A3-211ENST00000638876 TAF1LQ8IZX4 1826 aa29.18■■■□□ 2.26
SLC35A3-211ENST00000638876 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
SLC35A3-211ENST00000638876 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa29.18■■■□□ 2.26
SLC35A3-211ENST00000638876 NUDCQ9Y266 331 aa29.18■■■□□ 2.26
SLC35A3-211ENST00000638876 C4BP0C0L5 1744 aa29.17■■■□□ 2.26
SLC35A3-211ENST00000638876 LINC00116Q8NCU8 138 aa29.17■■■□□ 2.26
SLC35A3-211ENST00000638876 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
SLC35A3-211ENST00000638876 ITPK1Q13572 414 aa29.16■■■□□ 2.26
SLC35A3-211ENST00000638876 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
SLC35A3-211ENST00000638876 DCAF8L1A6NGE4 600 aa29.15■■■□□ 2.26
SLC35A3-211ENST00000638876 RNMTO43148 476 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 SYT17Q9BSW7 474 aa29.13■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 SLC52A2Q9HAB3 445 aa29.12■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 LGR6Q9HBX8 967 aa29.12■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 PHF14O94880 888 aa29.11■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 SSFA2P28290 1259 aa29.11■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.11■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 SLC4A9Q96Q91 983 aa29.11■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 GNPATO15228 680 aa29.1■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 SCN11AQ9UI33 1791 aa29.09■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 AMIGO3Q86WK7 504 aa29.08■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 MAP3K5Q99683 1374 aa29.08■■■□□ 2.25
SLC35A3-211ENST00000638876 PRKAR2BP31323 418 aa29.07■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 COL24A1Q17RW2 1714 aa29.07■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 MSL1Q68DK7 614 aa29.07■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.07■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF831Q5JPB2 1677 aa29.06■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 MRC1P22897 1456 aa29.05■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 KLHL34Q8N239 644 aa29.05■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.05■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa29.04■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.04■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 SMIM5Q71RC9 77 aa29.04■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 FCHSD2O94868 740 aa29.03■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.02■■■□□ 2.24
SLC35A3-211ENST00000638876 TRAPPC3LQ5T215 181 aa29.01■■■□□ 2.23
SLC35A3-211ENST00000638876 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa29.01■■■□□ 2.23
SLC35A3-211ENST00000638876 ADRA2BP18089 450 aa28.99■■■□□ 2.23
SLC35A3-211ENST00000638876 SLC39A6Q13433 755 aa28.99■■■□□ 2.23
SLC35A3-211ENST00000638876 RALBP1Q15311 655 aa28.99■■■□□ 2.23
SLC35A3-211ENST00000638876 RPS6KA4O75676 772 aa28.98■■■□□ 2.23
SLC35A3-211ENST00000638876 TEFQ10587 303 aa28.98■■■□□ 2.23
SLC35A3-211ENST00000638876 IL17REQ8NFR9 667 aa28.98■■■□□ 2.23
SLC35A3-211ENST00000638876 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
SLC35A3-211ENST00000638876 CRKLP46109 303 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
SLC35A3-211ENST00000638876 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
SLC35A3-211ENST00000638876 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.95■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 NEFMP07197 916 aa28.93■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.93■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 RFC4P35249 363 aa28.92■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.92■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.91■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.91■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.9■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 TJP1Q07157 1748 aa28.9■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.9■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.9■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 CCDC87Q9NVE4 849 aa28.89■■■□□ 2.22
SLC35A3-211ENST00000638876 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SLC35A3-211ENST00000638876 GPR162Q16538 588 aa28.88■■■□□ 2.21
SLC35A3-211ENST00000638876 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF790Q6PG37 636 aa28.88■■■□□ 2.21
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SLC35A3-211ENST00000638876 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
SLC35A3-211ENST00000638876 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
SLC35A3-211ENST00000638876 YY1P25490 414 aa28.86■■■□□ 2.21
SLC35A3-211ENST00000638876 BTBD11A6QL63 1104 aa28.85■■■□□ 2.21
SLC35A3-211ENST00000638876 MMP10P09238 476 aa28.85■■■□□ 2.21
SLC35A3-211ENST00000638876 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
SLC35A3-211ENST00000638876 GYS1P13807 737 aa28.84■■■□□ 2.21
SLC35A3-211ENST00000638876 MCM10Q7L590 875 aa28.84■■■□□ 2.21
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
SLC35A3-211ENST00000638876 STARD3NLO95772 234 aa28.83■■■□□ 2.21
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SLC35A3-211ENST00000638876 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
SLC35A3-211ENST00000638876 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.82■■■□□ 2.2
SLC35A3-211ENST00000638876 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.82■■■□□ 2.2
SLC35A3-211ENST00000638876 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
SLC35A3-211ENST00000638876 HEG1Q9ULI3 1381 aa28.82■■■□□ 2.2
SLC35A3-211ENST00000638876 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.82■■■□□ 2.2
SLC35A3-211ENST00000638876 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
SLC35A3-211ENST00000638876 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SLC35A3-211ENST00000638876 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.8■■■□□ 2.2
SLC35A3-211ENST00000638876 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.8■■■□□ 2.2
SLC35A3-211ENST00000638876 DCTN1Q14203 1278 aa28.79■■■□□ 2.2
SLC35A3-211ENST00000638876 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
SLC35A3-211ENST00000638876 ZPR1O75312 459 aa28.78■■■□□ 2.2
SLC35A3-211ENST00000638876 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.78■■■□□ 2.2
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