RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637140.1

ATP6AP2-222, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 2, human

TSL 2

Gene ATP6AP2, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ITGB2	P05107	769 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SEMA3F	Q13275	785 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NLRP3	Q96P20	1036 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RAD21	O60216	631 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	WWC1	Q8IX03	1113 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	USP4	Q13107	963 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PROC	P04070	461 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PODN	Q7Z5L7	613 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SIRT1	Q96EB6	747 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ALG2	Q9H553	416 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NCAPD3	P42695	1498 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	IL2RA	P01589	272 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RHOQ	P17081	205 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CNKSR1	Q969H4	720 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MBIP	Q9NS73	344 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	BCR	P11274	1271 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	POU4F2	Q12837	409 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	XAGE2	Q96GT9	111 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	IGF1R	P08069	1367 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GPR25	O00155	361 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PIK3CD	O00329	1044 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CENPC	Q03188	943 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	WDR44	Q5JSH3	913 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NBPF15	Q8N660	670 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GMCL1	Q96IK5	515 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	POM121C	A8CG34	1229 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ACD	Q96AP0	544 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	DBN1	Q16643	649 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SKI	P12755	728 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SCNN1D	P51172	638 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140		Q8N3U1	123 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	BAG6	P46379	1132 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GDF10	P55107	478 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	EML3	Q32P44	896 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	INHA	P05111	366 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TLR1	Q15399	786 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	KRBA1	A5PL33	1030 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140		H7C1W4	665 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	F11	P03951	625 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PHKA2	P46019	1235 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NOD1	Q9Y239	953 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	USP17L5	A8MUK1	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FURIN	P09958	794 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MX2	P20592	715 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NCOA4	Q13772	614 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	C4orf17	Q53FE4	359 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		7.23	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms