RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619898.4

SPCS1-206, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 4,254 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-206ENST00000619898 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-206ENST00000619898 TPM3P06753 285 aa14.71□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 STK3Q13188 491 aa14.71□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.71□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.71□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 MADDQ8WXG6 1647 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 SPG7Q9UQ90 795 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 OFD1O75665 1012 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 MCM5P33992 734 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 SIL1Q9H173 461 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 CLTCL1P53675 1640 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 AACSQ86V21 672 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 MSH6P52701 1360 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 LAMC1P11047 1609 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 RAB11FIP3O75154 756 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 TNMDQ9H2S6 317 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 ABCC4O15439 1325 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 ZMYND15Q9H091 742 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 ACEP12821 1306 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 ATF3P18847 181 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 PKP1Q13835 747 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 HIP1O00291 1037 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 FOXO3O43524 673 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 E9PCH4 1651 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 STX6O43752 255 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 ZNF445P59923 1031 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 G2E3Q7L622 706 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 ADCY5O95622 1261 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 USP48Q86UV5 1035 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 CAMK4Q16566 473 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 ANAPC15P60006 121 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 HS1BP3Q53T59 392 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 SPATA32Q96LK8 384 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 ATP8B2P98198 1209 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-206ENST00000619898 MAP3K11Q16584 847 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 SDF4Q9BRK5 362 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 CHMLP26374 656 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 ANKRD1Q15327 319 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 CHL1O00533 1208 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 UBE2HP62256 183 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 TET3O43151 1660 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 BTBD11A6QL63 1104 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 CPLX1O14810 134 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 GJB2P29033 226 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 KIF1BO60333 1816 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 DYNC1I1O14576 645 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 ANXA1P04083 346 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 KINO60870 393 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-206ENST00000619898 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms