RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 HYPKQ9NX55 129 aa23.77■■□□□ 1.4
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CTDP1-208ENST00000613122 ABCC11Q96J66 1382 aa23.77■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.77■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
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CTDP1-208ENST00000613122 MX1P20591 662 aa23.74■■□□□ 1.39
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CTDP1-208ENST00000613122 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.71■■□□□ 1.39
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CTDP1-208ENST00000613122 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
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CTDP1-208ENST00000613122 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.63■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 SKIDA1Q1XH10 827 aa23.63■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.63■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC184Q52MB2 194 aa23.63■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 CHMP4BP1P59074 171 aa23.62■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.62■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CTDP1-208ENST00000613122 PTPRCP08575 1304 aa23.62■■□□□ 1.37
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