RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCNQ3O43525 872 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SDSP20132 328 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.92■■□□□ 1.9
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SNX21Q969T3 373 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GNAI3P08754 354 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.89■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TEFQ10587 303 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANXA1P04083 346 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BTBD11A6QL63 1104 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 USP44Q9H0E7 712 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDE1AP54750 535 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP8B2P98198 1209 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MCM4P33991 863 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CASC1Q6TDU7 716 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 USP26Q9BXU7 913 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PXDNQ92626 1479 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DDIT3P35638 169 aa26.78■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.78■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.78■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.78■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.77■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.77■■□□□ 1.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLIT3O75094 1523 aa26.76■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MX1P20591 662 aa26.75■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.75■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.75■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HOXB7P09629 217 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RABEP1Q15276 862 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BEND3Q5T5X7 828 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERC2O15083 957 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATF3P18847 181 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PROSER3Q2NL68 480 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RILPL2Q969X0 211 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 REC8O95072 547 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SRGAP3O43295 1099 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SSH3Q8TE77 659 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERBB3P21860 1342 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARXQ96QS3 562 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADCY9O60503 1353 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NCAPD2Q15021 1401 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM94Q12767 1356 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAK2O60296 914 aa26.66■■□□□ 1.86
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