RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP26Q9BXU7 913 aa14.58□□□□□ -0.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANXA1P04083 346 aa14.57□□□□□ -0.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDE1AP54750 535 aa14.57□□□□□ -0.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.57□□□□□ -0.08
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNAI3P08754 354 aa14.55□□□□□ -0.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GCP02774 474 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP8B2P98198 1209 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.54□□□□□ -0.08
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LTN1O94822 1766 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CASC1Q6TDU7 716 aa14.52□□□□□ -0.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SSFA2P28290 1259 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEFQ10587 303 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RABEP1Q15276 862 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRC37A3O60309 1634 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RILPL2Q969X0 211 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BTBD11A6QL63 1104 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MX1P20591 662 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.5□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.5□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.5□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AK9Q5TCS8 1911 aa14.5□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NFAT5O94916 1531 aa14.5□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.5□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERC2O15083 957 aa14.5□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.5□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.5□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.5□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.5□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.49□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.49□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.49□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.49□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 REC8O95072 547 aa14.49□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PKP1Q13835 747 aa14.48□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.48□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.48□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PROSER3Q2NL68 480 aa14.48□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PANK2Q9BZ23 570 aa14.48□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.47□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRGAP3O43295 1099 aa14.47□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.47□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GBP4Q96PP9 640 aa14.47□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.46□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BEND3Q5T5X7 828 aa14.46□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.46□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SSH3Q8TE77 659 aa14.46□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PXDNQ92626 1479 aa14.46□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.46□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL25Q9H293 177 aa14.46□□□□□ -0.09
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CACNA1FO60840 1977 aa14.46□□□□□ -0.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PALD1Q9ULE6 856 aa14.45□□□□□ -0.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP54Q70EL1 1684 aa14.45□□□□□ -0.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FSD2A1L4K1 749 aa14.45□□□□□ -0.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHMLP26374 656 aa14.45□□□□□ -0.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.45□□□□□ -0.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEK4P51957 841 aa14.45□□□□□ -0.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ST18O60284 1047 aa14.44□□□□□ -0.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.44□□□□□ -0.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADCY9O60503 1353 aa14.43□□□□□ -0.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
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