RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603544.5

KIAA0391-205, Transcript of KIAA0391, human

TSL 5 BASIC

Gene KIAA0391, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIAA0391-205	ENST00000603544	KCNQ3	O43525	872 aa		11.36	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		11.36	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	RGPD5	Q99666	1765 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	NCAPD2	Q15021	1401 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	KIF2C	Q99661	725 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		11.34	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	TTC22	Q5TAA0	569 aa		11.34	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		11.34	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.34	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		11.33	□□□□□ -0.59
KIAA0391-205	ENST00000603544	KIF1A	Q12756	1690 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	ALS2	Q96Q42	1657 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	GNAI2	P04899	355 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	CDC45	O75419	566 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	MST1R	Q04912	1400 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	TMEM94	Q12767	1356 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	HMMR	O75330	724 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	ANXA1	P04083	346 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	SDS	P20132	328 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	TEF	Q10587	303 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	GNAI3	P08754	354 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	HSCB	Q8IWL3	235 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	GSE1	Q14687	1217 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	SNX21	Q969T3	373 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	ERBB3	P21860	1342 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	ATP8B2	P98198	1209 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	PDE1A	P54750	535 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIAA0391-205	ENST00000603544	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	HOXB7	P09629	217 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	ATF3	P18847	181 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	ADCY9	O60503	1353 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	COL18A1	P39060	1754 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	DDIT3	P35638	169 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	HSPA2	P54652	639 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	USP26	Q9BXU7	913 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	MEGF6	O75095	1541 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	DCC	P43146	1447 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	CHRNA2	Q15822	529 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	MX1	P20591	662 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	C5	P01031	1676 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	SLC39A6	Q13433	755 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIAA0391-205	ENST00000603544	POLA2	Q14181	598 aa		11.23	□□□□□ -0.61

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