RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 DLEC1Q9Y238 1755 aa10.82□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 THSD7BQ9C0I4 1608 aa10.81□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 POTECB2RU33 542 aa10.81□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 SSFA2P28290 1259 aa10.81□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 LBX1P52954 281 aa10.81□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 TMF1P82094 1093 aa10.81□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 RNF181Q9P0P0 153 aa10.81□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 FCHSD2O94868 740 aa10.8□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 MMP10P09238 476 aa10.8□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 WBP1LQ9NX94 342 aa10.8□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa10.79□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 PHF14O94880 888 aa10.79□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 AK7Q96M32 723 aa10.79□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF831Q5JPB2 1677 aa10.78□□□□□ -0.68
ZNF548-208ENST00000597576 GLTPD2A6NH11 291 aa10.77□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00116Q8NCU8 138 aa10.77□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 CD163L1Q9NR16 1453 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 A0A0C4DFX4 3053 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 PASKQ96RG2 1323 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 LTBP1Q14766 1721 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 SZT2Q5T011 3432 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 CUL9Q8IWT3 2517 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC85CA6NKD9 419 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 VEGFBP49765 207 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 AIDAQ96BJ3 306 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa10.74□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa10.74□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 SCN4AP35499 1836 aa10.74□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 IP6K1Q92551 441 aa10.73□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 TESK2Q96S53 571 aa10.73□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 PIM2Q9P1W9 311 aa10.73□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa10.73□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 POTEIP0CG38 1075 aa10.72□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 POTEJP0CG39 1038 aa10.72□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 RASSF7Q02833 373 aa10.72□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 ITPK1Q13572 414 aa10.72□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 NME9Q86XW9 330 aa10.72□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 TERF2IPQ9NYB0 399 aa10.72□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 NRXN2Q9P2S2 1712 aa10.72□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 GNPATO15228 680 aa10.71□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 CHADLQ6NUI6 762 aa10.71□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC87Q9NVE4 849 aa10.71□□□□□ -0.69
ZNF548-208ENST00000597576 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.7□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa10.7□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 GYS1P13807 737 aa10.7□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 LMNB1P20700 586 aa10.7□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 SIK1P57059 783 aa10.7□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa10.7□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 NLGN1Q8N2Q7 840 aa10.7□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 TMC1Q8TDI8 760 aa10.7□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 PIGBQ92521 554 aa10.69□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 POLR3GLQ9BT43 218 aa10.69□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 KDRP35968 1356 aa10.68□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 CYP27B1O15528 508 aa10.68□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 CHRNA5P30532 468 aa10.68□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa10.67□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa10.67□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 RASSF10A6NK89 507 aa10.67□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP10.67□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 HOXC9P31274 260 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 DDR1Q08345 913 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 NBPF6Q5VWK0 638 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 NBPF4Q96M43 638 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 TRPM7Q96QT4 1865 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM88BA6NKF7 163 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 NFKBIEO00221 500 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 PARP3Q9Y6F1 533 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-208ENST00000597576 MAP3K19Q56UN5 1328 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-208ENST00000597576 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-208ENST00000597576 TRAPPC3LQ5T215 181 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-208ENST00000597576 MCOLN1Q9GZU1 580 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-208ENST00000597576 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-208ENST00000597576 COL6A3P12111 3177 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-208ENST00000597576 KIF7Q2M1P5 1343 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-208ENST00000597576 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms