RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 FANCAO15360 1455 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 CFAP74Q9C0B2 1584 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 PLCH2O75038 1416 aa8.81□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.81□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 NR6A1Q15406 480 aa8.81□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.81□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.81□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.81□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.8□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 MADDQ8WXG6 1647 aa8.8□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.8□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.8□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 SLC35F4A4IF30 521 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 RELBQ01201 579 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 ZBTB33Q86T24 672 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 WHAMMQ8TF30 809 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 PREX2Q70Z35 1606 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 ITGA6P23229 1130 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 RASSF7Q02833 373 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 IL27Q8NEV9 243 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 KDM5CP41229 1560 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 PTPRMP28827 1452 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 CDC14CA4D256 554 aa8.76□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.76□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.76□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 RAB15P59190 212 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 SVOPQ8N4V2 548 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 ADAM32Q8TC27 787 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 RNF217Q8TC41 542 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 ABCC1P33527 1531 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 CLIP1P30622 1438 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 ABCA6Q8N139 1617 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 GDF11O95390 407 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 SLURP2P0DP57 97 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 PTK2Q05397 1052 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 SV2AQ7L0J3 742 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-212ENST00000597259 REREQ9P2R6 1566 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 AP1G2O75843 785 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 LILRA1O75019 489 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 ARHGEF15O94989 841 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 ADH1AP07327 375 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 ATP10AO60312 1499 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 AFAP1Q8N556 730 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms