RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596865.5

FCHO1-217, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-217ENST00000596865 ERVV-2B6SEH9 535 aa17.45■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 PAPPAQ13219 1627 aa17.45■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa17.44■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 GNAT3A8MTJ3 354 aa17.44■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 ITPK1Q13572 414 aa17.44■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa17.43■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 KCNQ3O43525 872 aa17.43■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 GAS2L2Q8NHY3 880 aa17.43■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 SLC52A2Q9HAB3 445 aa17.43■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 TAF1LQ8IZX4 1826 aa17.42■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 NEUROD2Q15784 382 aa17.42■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 AMIGO3Q86WK7 504 aa17.42■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.41■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 C5P01031 1676 aa17.4■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 MRC1P22897 1456 aa17.4■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 SLC15A2Q16348 729 aa17.4■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 LINC00116Q8NCU8 138 aa17.4■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 MRS2Q9HD23 443 aa17.4■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 MIS18AQ9NYP9 233 aa17.4■□□□□ 0.38
FCHO1-217ENST00000596865 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa17.39■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 SIK1P57059 783 aa17.39■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 NFE2L2Q16236 605 aa17.39■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 NBPF14Q5TI25 921 aa17.39■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 AKT1S1Q96B36 256 aa17.39■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 ATP6V1AP38606 617 aa17.38■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 STK32BQ9NY57 414 aa17.38■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 LRP5O75197 1615 aa17.37■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 SLC27A3Q5K4L6 730 aa17.37■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 TJP1Q07157 1748 aa17.37■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa17.37■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa17.37■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 CASZ1Q86V15 1759 aa17.36■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 RIPK4P57078 832 aa17.36■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 KCPQ6ZWJ8 1503 aa17.36■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 C4BP0C0L5 1744 aa17.35■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 TEFQ10587 303 aa17.35■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 RUNDC1Q96C34 613 aa17.35■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa17.34■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 ZBTB7AO95365 584 aa17.34■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa17.34■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 DNAJC10Q8IXB1 793 aa17.34■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
FCHO1-217ENST00000596865 APAF1O14727 1248 aa17.33■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 PHF14O94880 888 aa17.33■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 FAM9BQ8IZU0 186 aa17.33■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.33■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 UBR2Q8IWV8 1755 aa17.33■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 BTBD11A6QL63 1104 aa17.32■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 NEFMP07197 916 aa17.32■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa17.32■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 UBR3Q6ZT12 1888 aa17.31■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 ZNF790Q6PG37 636 aa17.3■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 MIER1Q8N108 512 aa17.3■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 MSH5O43196 834 aa17.29■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 MSL1Q68DK7 614 aa17.29■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 GNPATO15228 680 aa17.28■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 AK7Q96M32 723 aa17.28■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 CRKLP46109 303 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 TTC5Q8N0Z6 440 aa17.27■□□□□ 0.36
FCHO1-217ENST00000596865 KDM3BQ7LBC6 1761 aa17.27■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 QSER1Q2KHR3 1735 aa17.27■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 ZNF831Q5JPB2 1677 aa17.26■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 HEG1Q9ULI3 1381 aa17.26■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 KRT24Q2M2I5 525 aa17.25■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 USP16Q9Y5T5 823 aa17.25■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa17.24■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 A1BGP04217 495 aa17.23■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 PTGER2P43116 358 aa17.23■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 CANXP27824 592 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 FMNL2Q96PY5 1086 aa17.22■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa17.21■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 C4AP0C0L4 1744 aa17.21■□□□□ 0.35
FCHO1-217ENST00000596865 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms