RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 STK31Q9BXU1 1019 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 MEGF6O75095 1541 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 BTBD11A6QL63 1104 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPYL6Q8N831 410 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 NGLY1Q96IV0 654 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 RGS12O14924 1447 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 LGR6Q9HBX8 967 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPRCP08575 1304 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAMTS2O95450 1211 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM27P14373 513 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 PANK1Q8TE04 598 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 COG6Q9Y2V7 657 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 CABP4P57796 275 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP27B1O15528 508 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 MRC1P22897 1456 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC4A2P04920 1241 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 USP21Q9UK80 565 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 CACNA1FO60840 1977 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 USP35Q9P2H5 1018 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 EXOC5O00471 708 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT24Q2M2I5 525 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCC4O15439 1325 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF790Q6PG37 636 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 RLBP1P12271 317 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-212ENST00000591041 SLIT2O94813 1529 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 DISP2A7MBM2 1401 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 NRAPQ86VF7 1730 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 EP400Q96L91 3159 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 BARGINQ6ZT62 677 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 FLIIQ13045 1269 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 HEG1Q9ULI3 1381 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 TNS2Q63HR2 1409 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-212ENST00000591041 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-212ENST00000591041 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-212ENST00000591041 HYPKQ9NX55 129 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-212ENST00000591041 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-212ENST00000591041 DDB1Q16531 1140 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-212ENST00000591041 VPS72Q15906 364 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-212ENST00000591041 TNNQ9UQP3 1299 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-212ENST00000591041 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-212ENST00000591041 ATRNO75882 1429 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNQ3O43525 872 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-212ENST00000591041 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-212ENST00000591041 ERBB4Q15303 1308 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-212ENST00000591041 NECTIN2Q92692 538 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
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