RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590688.1

POP4-209, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 5

Gene POP4, Length 527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-209ENST00000590688 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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POP4-209ENST00000590688 ITPK1Q13572 414 aa20.49■□□□□ 0.87
POP4-209ENST00000590688 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.49■□□□□ 0.87
POP4-209ENST00000590688 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
POP4-209ENST00000590688 MTFR1LQ9H019 292 aa20.49■□□□□ 0.87
POP4-209ENST00000590688 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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POP4-209ENST00000590688 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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POP4-209ENST00000590688 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
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POP4-209ENST00000590688 NUDCQ9Y266 331 aa20.48■□□□□ 0.87
POP4-209ENST00000590688 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.47■□□□□ 0.87
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POP4-209ENST00000590688 MRC1P22897 1456 aa20.47■□□□□ 0.87
POP4-209ENST00000590688 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.47■□□□□ 0.87
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POP4-209ENST00000590688 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
POP4-209ENST00000590688 AK7Q96M32 723 aa20.46■□□□□ 0.87
POP4-209ENST00000590688 TJP1Q07157 1748 aa20.46■□□□□ 0.87
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POP4-209ENST00000590688 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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POP4-209ENST00000590688 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.45■□□□□ 0.86
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POP4-209ENST00000590688 MSL1Q68DK7 614 aa20.43■□□□□ 0.86
POP4-209ENST00000590688 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.43■□□□□ 0.86
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POP4-209ENST00000590688 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.42■□□□□ 0.86
POP4-209ENST00000590688 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.41■□□□□ 0.86
POP4-209ENST00000590688 RALBP1Q15311 655 aa20.41■□□□□ 0.86
POP4-209ENST00000590688 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.41■□□□□ 0.86
POP4-209ENST00000590688 GNPATO15228 680 aa20.4■□□□□ 0.86
POP4-209ENST00000590688 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
POP4-209ENST00000590688 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
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POP4-209ENST00000590688 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
POP4-209ENST00000590688 C4AP0C0L4 1744 aa20.38■□□□□ 0.85
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POP4-209ENST00000590688 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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POP4-209ENST00000590688 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
POP4-209ENST00000590688 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.31■□□□□ 0.84
POP4-209ENST00000590688 NEFMP07197 916 aa20.3■□□□□ 0.84
POP4-209ENST00000590688 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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POP4-209ENST00000590688 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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POP4-209ENST00000590688 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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POP4-209ENST00000590688 RFC4P35249 363 aa20.25■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 NFE2L2Q16236 605 aa20.25■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.25■□□□□ 0.83
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POP4-209ENST00000590688 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.24■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 ADRA2BP18089 450 aa20.24■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.24■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.24■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.23■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.22■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 MMP10P09238 476 aa20.22■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 GYS1P13807 737 aa20.22■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.22■□□□□ 0.83
POP4-209ENST00000590688 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.22■□□□□ 0.83
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